硬蜱科四种蜱核糖体全基因组分析

来源 :黑龙江八一农垦大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wu000mengya
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蜱是一种吸血的外寄生虫,常寄生于家畜和人的体表。作为媒介昆虫,是仅次于蚊的第二大传播媒介。它能携带病原体在宿主之间传播,其中大多数是重要的人兽共患病原。蜱主要分为硬蜱科,软蜱科和纳蜱科,其中最常见且对人和家畜危害性最大的是硬蜱科。核糖体在细胞中广泛存在,核酸拷贝数较高,核糖体是分子分类方法的主要标记基因。因此,本研究对在东北地区人畜危害严重的四种硬蜱即森林革蜱、日本血蜱、全沟硬蜱和长角血蜱的核糖体基因组序列进行扩增及分析,为四种硬蜱的分子分类研究提供可靠依据。首先在东北地区采集各种蜱,对每只蜱进行形态学和分子生学鉴定;然后随机选择采至黑龙江省的森林革蜱、日本血蜱和全沟硬蜱各5只,同时选择吉林省和辽宁省的长角血蜱各5只,总计25只硬蜱进行核糖体序列的扩增;进一步对获得的序列进行拼接组装,并比较序列长度,组成及结构特点;最后进行同源性和进化分析。结果表明,首次获得了森林革蜱、日本血蜱、全沟硬蜱和长角血蜱四种25条硬蜱核糖体全基因组序列,长度为8629~11346 bp。不同种类蜱18S、28S和5.8S长度相近或相同,而ITS1和ITS2长度均能表现种属的特异性;IGS的长度变化在种间或种内均没有特征性规律,且在IGS的长度的变化是核糖体长度不同的主要原因。另外本试验中25只蜱的IGS序列靠近28S边界一侧的89bp和靠近18S边界一侧19bp的碱基,相似度均为100%,这一现象被认为是基因内间隔区的侧翼。森林革蜱有5对特有的重复序列,全沟硬蜱有40对特有的重复序列,有一对重复序列是除全沟硬蜱没有以外,其他三种蜱种共有的。通过比较发现四种蜱间18S、ITS1、5.8S、ITS2、28S和IGS同源性分别为95.2~99.8%、23.4~100%、96.1~100%、27.5~100%、88.0~100%和12.9~100%,由此可见,核糖体六段序列的保守性排序依次为:5.8S>18S>28S>ITS2>ITS1>IGS。核糖体18S、ITS1、ITS2和28S在分子分类中具有重要的意义,但不能有效区分地域株。5.8S由于保守性较高而不能作为蜱分子分类的依据,IGS变异率太大且缺乏变异规律无法用于蜱的进化分析,但是其重复序列有一定规律。本研究首次获得了硬蜱科四蜱25只蜱的核糖体全基因组,并对其进行序列分析和同源性分析,丰富了硬蜱科的核糖体全基因组的数据,确定了各段基因的保守性排序,使用核糖体各段基因构建蜱的进化树,探讨了蜱种内和种间的进化关系,可为硬蜱科的分类及深入研究提供可靠依据。
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