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大气是一个统一的整体，各层之间存在相互作用。平流层准两年振荡(QBO)有可能通过一些中间过程，对对流层的南海夏季风系统产生影响。本文运用1979～2001年NCEP、ECMWF再分析资料，分析了QBO对南海夏季风建立时间和强度的影响及其物理机制。经小波分析，确定QBO的周期约27个月。通过EOF分析考察了QBO向下传播的时空变化特征，时间系数反映的周期与小波分析一致。QBO位相与南海夏季风爆发时间及强度有很好的对应关系：超前南海夏季风爆发约18个月的QBO西(东)风位相对应了季风爆发时间偏早(晚)；超前南海夏季风爆发约7个月的QBO东(西)风位相对应了季风强度偏强(弱)。QBO位相极值在30hPa出现后，经过10个月下传到对流层顶，在其后几个月里以对流层内的过程为媒介，对南海夏季风系统产生影响。为分析QBO引起的对流层的变化，按季风爆发早晚和QBO位相分别合成了平流层和对流层的风场、对流层顶风切变、对流层顶气压和温度、OLR和SST。通过分析上述参数的时空分布特征，发现在热带东印度洋和南海南侧，对流层顶风切变和高度的变化发生在OLR的变化之前，OLR的变化又先于SST的变化，SST的变化最终会导致低层风场的变化。
最后，探讨了QBO影响南海夏季风的物理机制。结果表明：季风爆发前18个月，30hPaQBO西风位相出现，10个月后下传到平流层底部，使对流层顶高度增加、风切变偏小，有利于对流．发展。在往后4个月内，云量的增加阻挡了更多的入射太阳辐射，导致季风爆发前赤道东印度洋和南海南侧的SST降低，增大了海陆之间的温度梯度，有利于南海夏季风爆发早和强度强。相反，QBO东风位相则有利于南海夏季风爆发晚和强度弱。