论文部分内容阅读
目的:挖掘胰腺癌和正常胰腺组织之间的差异性表达基因,分析差异表达基因与胰腺癌患者预后及临床病理因素的关系,并初步探讨引起基因差异表达的原因。方法:利用Oncomine数据库及其提供的分析工具挖掘胰腺癌和正常胰腺组织的之间的差异表达基因,结合文献搜索结果选择靶差异基因,并使用GEO(Gene Expression Omnibus)数据库的多个胰腺癌数据系列验证该基因的差异性表达。从TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库提取胰腺癌患者的临床病理资料及靶差异基因mRNA、蛋白表达数据及启动子甲基化数据,分析靶差异基因表达与预后及临床病理因素的关系,并使用GEO数据库的胰腺癌数据系列验证靶差异基因与胰腺癌患者预后的关系。收集本院及兄弟医院接受手术治疗的胰腺癌患者及因胆管下段或者十二指肠病变接受胰十二指肠切除术患者的临床资料,使用免疫组织化学染色的方法分析靶差异基因在胰腺癌组织及正常胰腺组织中的表达情况,并分析靶差异基因与胰腺癌患者预后及临床病理因素的关系,对数据库分析结果进行验证。结果:Oncomine在综合分析9个胰腺癌VS正常胰腺组织数据集后发现CDH3/P-钙黏素是胰腺癌和正常胰腺组织之间差异性表达的top 1基因;三个GEO数据系列(GSE62452、GSE15471和GSE16515)均证实CDH3/P-钙黏素在胰腺癌组织和正常胰腺组织之间存在差异性表达,即胰腺癌组织中的CDH3/P-钙黏素表达水平显著高于配对正常胰腺组织;本院及兄弟医院61例胰腺癌患者免疫组织化学染色结果显示,CDH3/P-钙黏素阳性率为88.5%,13例正常胰腺组织均不表达CDH3/P-钙黏素。TCGA mRNA队列共154名患者,其中CDH3/P-钙黏素高表达组有100(64.9%)名患者,低表达组有54(35.1%)名患者;CDH3/P-钙黏素是胰腺癌患者术后OS(P=0.036,HR:1.672,95%CI:1.034-2.705)及DFS(P=0.034,HR:1.742,95%CI:1.042,2.912)的独立危险因素;高表达组1、2、3年总生存率分别为67.2%、28.0%、22.2%,低表达组1、2、3年总生存率分别为88.3%、46.2%、37.7%;高表达组1、2、3年无病生存率分别为51.6%,17.5%和9.1%,低表达组1、2、3年无病生存率分别为75.2%,36.0%和25.2%。CDH3/P-钙黏素蛋白表达队列结果与mRNA队列结果相似。两个GSE数据系列(GSE57495和GSE78229)均证实CDH3/P-钙黏素高表达组预后差于低表达组。本院及兄弟医院61名胰腺癌患者,高表达组22人,低/不表达组39人,CDH3/P-钙黏素表达是术后OS的独立危险因素(HR=2.900,95%CI:1.227-6.585,P=0.011)。TCGA mRNA队列及蛋白队列均表明CDH3/P-钙黏素表达与R1切除率有关,高表达组R1切除率高于低表达组(19.0%VS 9.3%,P=0.036;48.8%VS 21.4%,P=0.041)。本院及兄弟医院患者队列表明CDH3/P-钙黏素表达与临近脏器侵犯发生率有关,高表达组临近脏器侵犯发生率更高(68.2%VS 28.2%,P=0.000)。TCGA mRNA队列及蛋白队列均表明CDH3/P-钙黏素表达与启动子甲基化水平呈负相关(r_s=-0.060,P=0.000;r_s=-0.395,P=0.000)。结论:CDH3/P-钙黏素在胰腺癌组织和正常胰腺组织之间存在差异性表达,癌组织表达水平显著高于正常组织,且这种高表达与低启动子甲基化水平有关。CDH3/P-钙黏素是胰腺癌患者术后OS和DFS的独立危险因素,且与胰腺癌的侵袭性生物学行为相关,可作为评价胰腺癌患者预后及恶性程度的一个指标。