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利用比较基因组学等技术,本文成功地鉴定和克隆了2个鱼类免疫相关基因——黑青斑河豚ILF2基因(TnILF2)和IL-21基因(TnIL-21)。TnILF2cDNA序列长1380bp,其中5UTR长57bp,3UTR长159bp,ORF长1164bp。根据TnILF2的ORF推导出的多肽长387个氨基酸,分子量为42.9kD。在TnILF2多肽序列上存在多个修饰位点和功能位点,包括2个N-糖基化位点、多个磷酸化位点、1个富含RGG的单链RNA结合基序以及1个DZF锌指结构。氨基酸序列比较显示,TnILF2与其它物种ILF2蛋白的相似性为58%~93%。组织表达分析表明,在被检测的7个正常组织中,TnILF2基因为组成性表达;LPS诱导并不能显著改变TnILF2在这些组织中的表达量。将TnILF2CDS序列克隆到真核表达载体pcDNA3.1+中,得到重组载体TnILF2-pcDNA3.1+,测序结果显示目的基因序列及读码框均正确,表达载体构建成功。
TnIL-21cDNA序列长849bp,其中5UTR长69bp,3UTR长342bp,ORF长438bp。根据TnIL-21ORF推导的多肽长145个氨基酸,分子量为16.5kD。在TnIL-21多肽含有1个由22个氨基酸组成的N端信号肽及多个修饰位点和功能结构位点,如N-糖基化位点、磷酸化位点和亮氨酸拉链等。TnIL-21成熟肽含有4个α-螺旋结构,4个半胱氨酸残基(Cys61,Cys68,Cys110,Cys113)和1个谷氨酰胺残基(Gln133)。氨基酸序列比较显示,TnILF2与其它物种IL-21蛋白的相似性很低,只有20%~49%。TnIL-21仅在正常鱼体组织的鳃、肠和性腺中有少量表达,LPS刺激能诱导TnIL-21在头肾和脾脏中表达。基因定位比较显示,IL-21基因在黑青斑河豚、红鳍东方豚以及人类中具有保守的共线性。将TnIL-21CDS序列克隆到原核表达载体pET32b中,成功地构建重组载体TnIL21-pET32b,并建立其原核表达体系,成功诱导目的蛋白的大量表达。
TnILF2和TnIL-21基因的鉴定和克隆以及表达载体的构建,为以后开展基因功能研究奠定了基础。