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microRNAs (miRNAs)是一类内源性表达的非编码的小分子RNA,它对基因的转录和表达起着重要的负调控作用,主要通过与其靶基因的完全配对降解靶基因或者不完全配对阻遏靶基因的翻译来发挥作用,在植物的生长发育过程中起着重要的调控作用。自2002年第一个植物miRNA被报道以来,越来越多的植物miRNA被相继发现,主要通过高通量测序分析和生物信息学预测的方法进行miRNA及其靶基因的发掘工作。为了研究miRNA及其靶标在棉花染色体上的分布情况,我们对到2011年4月为止所公布的miRNA前体及潜