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生物的智能行为一直被研究者所关注,生物的神经系统、遗传进化系统已被人们广泛研究,并在实际应用中取得了引人注目的成效。近年来,生物免疫系统也引起了人们的极大兴趣。生物免疫系统通过识别生物体内的所有细胞并区分外部有害抗原和自身组织,产生抗体,以清除病原并保持机体的稳定。基于生物免疫系统的免疫机理发展的人工免疫系统,其应用已经涉及到故障诊断、智能优化、信息安全等许多领域,显示出人工免疫系统强大的信息处理和问题求解能力以及广阔的研究前景。目前,人工免疫系统的研究已经引起国内外学者的广泛关注和重视,但是对免疫理论除在工程应用以外的其他领域的研究并不多见。本文尝试将免疫相关理论与模型引入项目合同管理,首先将生物免疫系统与项目合同管理相结合,给出项目合同免疫管理的理论框架和基本模型;随后介绍常用免疫算法在项目合同管理中的应用,给出整个算法流程;最后以建设项目为例,在合同卖方选择阶段建立起基于免疫算法的工程评标模型,并结合免疫残余抗原模型进行风险的监控管理。全文共分八章,第一章提出本文研究的问题,对人工免疫进行简要介绍,简述了国内外的研究现状。第二章主要介绍生物免疫学的发展历史和生物免疫系统的构成。第三章提出项目合同免疫管理系统的基本思想,并对项目合同免疫管理模型做了介绍。第四章介绍常用免疫算法流程,并对其在项目合同免疫管理中的应用予以展示。第五章主要从宏观上分析目前工程项目合同管理中所存在的问题,提出相应的免疫策略。第六章针对目前工程合同卖方选择中存在的问题,建立基于免疫算法的工程评标模型,通过MATLAB予以实现。第七章结合第三章中介绍的残余抗原模型,提出一套有效的合同风险监控方法,对合同成本和进度风险的管理提供有力的帮助,并通过实例加以说明。第八章总结了本文研究的内容并提出了对未来研究工作的展望。