不同林型空气细菌群落特征研究

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城市区域的地理状况复杂,环境条件多变,空气微生物受人类活动的影响较大。因而在城市的不同区域,空气微生物群落结构及多样性特征差异明显。而森林生态系统有着不同于城市的空气微生物群落,影响空气微生物群落结构和多样性的因素也可能更为复杂。近年来对于森林空气真菌的研究让我们很好的了解到空气真菌在不同森林环境下的群落结构和多样性特征,以及影响森林空气真菌孢子浓度、群落结构和多样性特征的主要因素。相比之下我们对森林环境下空气细菌群落的了解则相对较少。因此,有必要研究森林内空气细菌的群落结构和多样性特征,以及和森林空气细菌群落相关的环境因子。本研究利用撞击式采样的方法收集杉木林(CL)、针阔混交林(MF)、阔叶林(LC)、荔枝林(LC)、毛竹林(PH)以及林间道路(CK)上的空气细菌,然后对采集的54个样品进行16S rDNA高通量测序,同时收集林内小气候、林冠结构以及土壤理化特性等环境因子。通过分析不同林地类型以及林间道路中空气细菌群落的结构特征、多样性特征以及可能影响空气细菌群落的主要因素,促进了我们对森林生态系统中空气细菌群落的进一步了解。主要研究结果有:(1)植被覆盖的森林区域拥有更多特异的空气细菌种类,CL、MF、BF、LC、PH这5个林型共分类得到的总OTU数依次递减,分别为816、689、635、583、557,均大于CK(520)。空气细菌种类越多的林型,样地之间特有的空气细菌种类也越多。CL、MF、BF、LC、PH、CK内三个重复样地共有的OTU数分别为247、236、239、250、255、244,占该林型总OTU数的百分比依次递增,与总OTU数成反比。(2)不同林型和林间道路上丰度大于1%的优势菌门和菌属均相同,且优势菌门和菌属的丰度高度相似,非优势菌门和菌属虽然丰度较低,但是种类丰富。5种林型及林间道路的优势菌门均为变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes),占总数的53.76%和45.97%。优势菌属均为柠檬酸杆菌属(Citrobacter)、不动杆菌属(Acinetobacter)、假单胞菌属(Pseudomonas)、芽孢杆菌属(Bacillus)、肠球菌属(Enterococcus)和链球菌属(Streptococcus),共占总数的55.53%。CL和MF中各菌门和主要菌属的丰度均高于其他林型,并且这两个植被组成类似的林地类型,空气细菌群落结构也更为相似。PH、LC与CK在门水平上的群落结构相似性较高,LC和BF;PH和CK在属水平上的群落结构相似性较高。(3)不同林地类型及林间道路对空气细菌丰富度和多样性的影响不显著,但是对空气细菌群落系统发育多样性的影响显著。CL中空气细菌群落的丰富度和均匀度较高,LC中的群落多样性较低,CL与MF、CL与BF以及CK、PH和LC三者之间的空气细菌群落多样性差异较小,而MF与CK、LC群落多样性的差异性较大。(4)相比于小气候环境和林冠结构,土壤环境和空气细菌群落的相关性更大。与环境因子显著相关的菌属有柠檬酸杆菌属(Citrobacter)、假单胞菌属(Pseudomonas)、不动杆菌属(Acinetobacter)、肠球菌属(Enterococcus)、链球菌属(Streptococcus)和串珠菌属(Leuconostoc)。除串珠菌属(Leuconostoc)和林冠结构的相关性较大外,其他菌属的群落结构和多样性和土壤pH、土壤有效钾含量、土壤有效磷含量、酸性磷酸酶含量、土壤脲酶含量、土壤温度等土壤理化性质的相关性较大。其中,土壤pH、土壤有效钾含量、土壤有效磷含量、土壤脲酶含量被聚为一类,酸性磷酸酶含量和土壤温度聚为一类,两个类别的环境因素对空气细菌群落结构的作用相反。
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