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本论文主要利用酵母双杂交系统研究棉铃虫核多角体病毒(HearNPV)包涵体来源型病毒粒子(ODV)囊膜蛋白之间的相互作用。论文包括四个章节。第一章以文献综述的形式介绍了杆状病毒蛋白组学研究进展，着重介绍了ODV囊膜蛋白的研究进展；同时介绍了酵母双杂交的各种系统在研究蛋白相互作用中的应用。最后说明了本论文研究的内容和意义。
第二章利用酵母双杂交方法对HearNPV ODV囊膜蛋白的相互作用进行了筛选。我们针对HearNPV ODV中10个含跨膜区的基因，构建了13对克隆。将这10个基因在去掉跨膜区后分别克隆进pGBKT7(诱饵蛋白载体)及pGADT7(靶蛋白载体)中。将构建好的pGBKT7克隆转化进酵母菌AH109中，获得能分别表达13种诱饵蛋白的酵母菌株，在此基础上再依次转化进构建好的13种去跨膜区蛋白的pGADT7系列克隆及29种ODV结构蛋白的pGADT7系列克隆，在营养缺陷型的培养基上筛选蛋白相互作用。通过酵母双杂交筛选，发现了12对蛋白-蛋白相作用。并通过测定β半乳糖苷酶活性来确定蛋白相互作用的相对强弱。第三章为了进一步了解相互作用蛋白的生物学特性，笔者对第二章中发现的可能形成蛋白复合体的4个囊膜蛋白即ODV-E56，ODV-E66，PIF2，PIF3用生物信息学的方法作了进一步的分析。所用的生物信息学方法有：利用COILS分析coiled-coil结构域；利用2-ZIP分析Leucine-zipper结构域；利用Interproscan分析蛋白功能性的结构域及利用CDD分析保守性的结构域；利用NetOGlyc，NetNGlyc，GPI-Anchor分析糖基化；利用TatP分析双精氨酸信号；用同源比对的方法分析保守性氨基酸。结果表明ODV-E56的N端具有TatP信号肽，中部具有Coiled-coil结构域，C端具有跨膜区；ODV-E66，PIF2，PIF3的N端都具有信号肽和跨膜区；ODV-E66含有多糖裂解酶家族8的结构域，此结构域在同源蛋白中相当保守；ODV-E56，PIF2，PIF3都含有糖基化位点，也分别含有保守的半胱氨酸。上述生物信息学的分析结果为深入研究上述蛋白提供了一定的参考。第四章本章将三种目的蛋白ODV-E66，PIF2，PIF3在截去跨膜区的基础上，做了第二次截短。截短的区域分别包括了蛋白的N和C端。将截短后的片段分别克隆到pGBKT7(诱饵蛋白载体)及pGADT7(靶蛋白载体)中。将构建好的pGBKT7克隆转化进酵母菌AH109中，获得能分别表达诱饵蛋白的酵母菌株，在此基础上再依次转化进第二章中构建好的与三种蛋白具有相互作用蛋白的pGADT7克隆，然后用营养缺陷型的培养基确认二次截短的蛋白相互作用是否仍然存在。结果显示ODV-E66的N端50个氨基酸及PIF3的C端20个氨基酸可能参与了蛋白的相互作用，而PIF2的N端54个氨基酸及C端20个氨基酸截短后的片段与其它蛋白的相互作用仍然存在。