美洲南瓜遗传图谱的构建与果实形状相关性状QTL定位

来源 :东北农业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:JockWang
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美洲南瓜(Cucurbita pepo L.)属于葫芦科(Cucurbitaceae)南瓜属(Cucurbita)一年生蔓性草本植物,在世界上栽培范极广,深受消费者喜爱。南瓜果实形状和大小直接影响其商品价值,是优良南瓜品种选育的重要目标之一。本试验以两个美洲南瓜纯合自交系‘X10’和‘JIN234’为亲本构建F2分离群体并绘制遗传连锁图谱,并对南瓜果实长度、果实宽度和果形指数等三个果实形状相关性状进行遗传规律分析和QTL定位分析,结果如下:(1)对F2群体成熟南瓜果实的果实长度、果实宽度和果形指数等三个性状进行遗传规律分析,其频率分布基本符合正态分布,说明这三个性状均为多个基因控制的数量性状。相关性分析表明,果实长度分别与果实宽度、果形指数呈极显著正相关,而果实宽度与果形指数呈极显著负相关。(2)本试验共筛选1589个SSR标记,筛选出122个在两亲本间多态性良好且在F2群体中能清晰分型的SSR标记,多态率约为7.7%。其次利用亲本重测序的SNP数据共开发217个CAPS标记,筛选出126个具有多态性且在F2群体能中清晰分型的CAPS标记,多态率约为58%。以F2群体的93个单株为作图群体,使用QTL Ici Mapping V4.1软件对试验所得的248个分子标记数据进行遗传连锁分析并绘制一张美洲南瓜遗传连锁图谱,该图谱共20个连锁群,与南瓜的20条染色体一一对应,图谱覆盖的基因组总长度2256.56c M,平均遗传距离为9.17c M。其中第1号连锁群最长,共220.05c M;第20号连锁群最短为57.74c M,含有10个分子标记。(3)本试验利用2017年F2与2018和2019年F2:3果实表型数据共检测到15个与果实形状相关的QTL,分布于第1、2、3、6、7、20号连锁群上。利用3年数据共检测到7个与果实长度相关的QTL,其中位于第三号连锁群LG3-54510和LG3-756833两个标记之间的果实长度QTL Fl3.2在三年QTL定位均被检测到,三年贡献率分别为39.01%、31.89%和40.70%;除以上三年检测重合的QTL外,位于第三号连锁群的果实长度QTL Fl3.1在2018与2019年检测中也都被检测到,贡献率分别为9.95%和8.08%;其余5个QTL均为贡献率相对较低的微效QTL,并且只能在三年检测中的某一年被检测到。(4)利用3年数据共检测到4个与果实宽度相关的QTL,其中位于第三号连锁群的QTL Fw3.1在2018和2019年试验中均被检测到,贡献率分别为15.97%和10.18%;而其余3个QTL只能在3年检测中的某一年被检测到,这三个QTL为Fw7.1、Fw7.2和Fw20.1,它们的贡献率分别为18.96%、14.26%与12.9%。(5)利用3年数据共检测到4个与果形指数关的QTL,其中位于第三号连锁群LG3-54510和LG3-756833两个标记之间的果形指数QTL Fsi3.2在三年QTL检测中均被检测到,贡献率分别为44.97%、46.77%和37.55%,为主效QTL;其余三个QTL在三年QTL检测中只能被检测到一次,均为贡献率较低的微效QTL。
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