【摘 要】
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印度南瓜(Cucurbita maxima)是葫芦科(Cucurbitaceae)南瓜属(Cucurbita)的重要栽培品种之一,是菜油兼用的蔬菜也是重要的园艺经济作物,在世界范围内广泛栽培。我国既是南瓜消费大国也是南瓜种植大国,南瓜产业在我国的国民经济和现代都市农业中都发挥着重要作用。南瓜籽粒中含有丰富的营养物质是大众喜爱的瓜子,其籽粒大小和百粒重是评价南瓜籽粒商品价值的重要指标,因此解析印度南
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印度南瓜（Cucurbita maxima）是葫芦科（Cucurbitaceae）南瓜属（Cucurbita）的重要栽培品种之一,是菜油兼用的蔬菜也是重要的园艺经济作物,在世界范围内广泛栽培。我国既是南瓜消费大国也是南瓜种植大国,南瓜产业在我国的国民经济和现代都市农业中都发挥着重要作用。南瓜籽粒中含有丰富的营养物质是大众喜爱的瓜子,其籽粒大小和百粒重是评价南瓜籽粒商品价值的重要指标,因此解析印度南瓜籽粒性状的QTL位点,可以提高印度南瓜育种效率。本试验以印度南瓜自交系‘2013-12’和‘9-6’为亲本,构建F2群体对籽粒大小进行QTL定位分析,前期研究已经将籽粒长度和籽粒宽度相关的QTL位点定位在6号染色体上。为进一步验证籽粒长度和籽粒宽度的定位结果,本研究在印度南瓜6号染色体上开发CAPS和In Del引物扫描150株F2群体。将F2和F2:3群体的表型数据和F2群体的基因型数据结合分析,定位籽粒长度和籽粒宽度QTL位点。根据印度南瓜基因注释,在籽粒长度和籽粒宽度QTL区间内筛选影响籽粒大小的候选基因。主要研究成果如下:（1）籽粒长度、籽粒宽度、籽粒长宽比、百粒重和单瓜籽粒数5个籽粒性状都属于数量性状。（2）由F2:3群体籽中粒性状间的相关性分析可知,籽粒长度和籽粒宽度呈正相关;籽粒长宽比和籽粒长度呈正相关,籽粒长宽比与籽粒宽度呈负相关;百粒重与籽粒宽度和籽粒长度皆呈正相关;单瓜籽粒数与其余4个籽粒性状均无相关性。（3）利用亲本重测序和印度南瓜基因组数据,在印度南瓜6号染色体上开发17个CAPS标记和7个In Del标记,其中9个CAPS标记和2个In Del标记具有多态性,CAPS标记多态率为52.94%,In Del标记多态率为28.57%。（4）在印度南瓜6号染色体上构建一张包含11个分子标记的遗传图谱,该图谱总长为64.48c M,标记间平均距离为5.86c M。在标记Chr06＿2374213和Chr06＿3507675（2.37-3.51Mb）之间检测到1个与籽粒长度相关的QTL位点SL6-1F2,该QTL的LOD值为3.6,可解释22.2%的表型变异率。在标记Chr06＿1468248和Chr06＿1929605（1.47-1.93Mb）之间检测到1个与籽粒宽度相关的QTL位点SW6-1F2,该QTL可解释20.8%的表型变异率,LOD值为4.8。（5）籽粒长度QTL区域中有15个基因在两亲本间存在非同义SNP突变位点,籽粒宽度QTL区域中有7个基因在两亲本间存在非同义SNP突变位点。根据印度南瓜参考基因组注释,筛选出3个可能是籽粒大小的候选基因,并分析3个基因在两亲本间的多态性。在控制籽粒长度QTL区域中,基因编码富含泛素连接酶E3的Cma Ch06G005450.1和基因编码富含VQ序列的Cma Ch06G005530.1,其保守区域中各存在1个SNP突变位点。在控制籽粒宽度QTL区域中,基因编码为亮氨酸（LRR）重复序列的Cma Ch06G004140.1,其C2末端保守结构域和染色体结构维持蛋白保守结构域中各存在1个SNP突变位点。3个基因中保守序列的非同义SNP突变位点,可能会影响蛋白质功能,进而推测这3个基因可能对籽粒长度和籽粒宽度有潜在影响。
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