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在植物和线虫中,RNAi(RNAinterference,RNA干涉)可以在细胞与细胞之间传递,这种现象被称为系统性RNAi(systemicRNAi)。线虫sid-1基因(systemicRNAiinterferencedeficient)是Wiston等人于2002年在研究线虫RNAi现象时发现的与线虫的系统性RNAi相关的一个新基因,如果该基因突变,线虫将丧失系统性RNAi。
迄今为止,已在小鼠、大鼠及人等多种生物中发现sid-1基因的同源基因存在,但是关于其功能的研究尚未见报导。为研究哺乳动物细胞中RNAi的机制及该类基因的功能,我们克隆了小鼠的sid-1同源基因,序列分析发现我们所扩增的序列较GeneBank所公布的BC025888序列多出15个bp,其编码的蛋白较公布序列多出5个氨基酸,因此我们认为这是一个新的编码基因,命名为msid2,并在GeneBank登录,序列号为AY562214。然后我们分析了其功能域、基因组结构、染色体定位及表达谱特征。基因组分析表明,该基因定位于小鼠16号染色体,基因组序列大约为26kb,含14个外显子和13个内含子,该基因编码区全长1353bp,编码450氨基酸残基的碱性蛋白。生物信息学分析表明,mSID2蛋白可形成2个亮氨酸拉链(110-131,117-138氨基酸),1个DED结构域(82-145氨基酸),1个cyclin结构域(334-409)。RT-PCR方法证明msid2基因在成年及新生小鼠的大脑、小脑组织表达明显高于非神经组织;原位杂交显示msid2基因在10.5及12.5天小鼠胚胎的端脑、间脑及后脑中表达高,其他组织表达不明显;另外在成体的大脑皮层、海马及脊髓的神经元胞体中均有明显表达。
利用pEGFP-N1载体融合msid2全长基因及其不同片段瞬时转染CHO细胞及COS-7细胞发现,mSID2蛋白定位于细胞的内膜系统,而且其C-端(400-450aa)的最后一个跨膜区对其正确定位有重要作用。形态观察及流式细胞仪检测发现转染msid2全长基因及其不同片段于CHO细胞及COS-7细胞发现,24小时可导致细胞G0-G1期阻滞,48小时、72小时可导致部分细胞凋亡。
发育表达谱表明,msid2基因可能参与神经系统的发育或分化。为了msid2基因研究msid2基因对神经细胞分化的影响,我们将msid2全长基因稳定转染P19细胞,结果发现转染msid2基因后可导致P19细胞的体外增殖能力下降,粘附性增强,在维甲酸诱导下不能悬浮成球,故不能分化为神经元。这些结果提示msid2基因影响了P19细胞向神经元的分化。