鸡胃肠道黏膜微生态的组成和动态变化研究

• 作 者: 张洁
• 机 构: 华南农业大学
• 出 处: 华南农业大学
• 发表日期: 2010年期
• 关键词: 岭南黄鸡 胡须鸡 胃肠道黏膜微生态 随机克隆文库 生产性能

本实验拟以两种不同的品系作为实验素材（岭南黄羽鸡和胡须鸡,以下分别称为A组和B组）,研究两种品系在不同生长阶段肠道黏膜微生态的组成及其动态变化。岭南黄羽肉鸡属于快速型,胡须鸡属于慢速型,对比两者间在肠道黏膜微生态的组成和动态变化的差别,探讨两者在生产性能上的差异是否与其肠道黏膜微生态组成不同有关,从而为开发改善家禽生产性能的新型微生态添加剂奠定理论基础。本实验应用了两种不同的分子生物学方法研究胃肠道黏膜微生态,应用PCR-DGGE方法研究不同日龄胃肠道黏膜微生物丛组成结构和动态变化；采用16S rDNA基因序列分析技术建立28日龄回肠和盲肠的随机克隆文库,比较不同品系间肠道黏膜微生物组成。实验研究结果如下：(1)通过PCR-DGGE分析发现A、B两组嗉囊、腺胃和盲肠黏膜微生物菌群结构的相似度较高,其动态变化趋势基本一致,28日龄两组嗉囊相似度为70％,腺胃相似度为77％,盲肠黏膜菌群的相似度为73％；两个不同品系的小肠（包括十二指肠、空肠、回肠）菌群结构相对简单,其动态变化趋势不太相同,28日龄两组小肠的相似性较低,十二指肠为40％,空肠为44％,回肠为18％,差异最明显。　　
(2)由A、B组28日龄黏膜细菌随机克隆文库发现,回肠随机克隆文库结构相对简单,两组的细菌种类和所占比例有差异。A组黏膜细菌文库86个序列共产生6个OTU,B组97个序列共产生4个OTU。A和B回肠克隆文库中出现频率最高的是在Genbank中登录号为FJ471462,在RDP中未找到的一种细菌,分别占86％（74个序列）和77％（75个序列）,未分类的梭菌属分别占2％（2个序列）和15％（14个序列）；A组发现有乳酸菌属（占3％）,肠球菌属（占6％）,粪球菌属（占1％）,而在B组未发现；A组出现一类未知序列占2％,B组出现两类不同的未知序列共占8％。A、B组盲肠黏膜细菌随机克隆文库,细菌丰富度高。A组盲肠黏膜细菌随机克隆文库93个序列,共产生47个OTU,B组96个序列,共产生41个OTU。A组的优势菌群是未分类的毛螺菌属(19.4％)、未分类的瘤胃球菌属(14.O％)和拟杆菌属(11.8％)；B组的优势菌群为普拉梭杆菌属(18.8％)、未分类的毛螺菌属(10.4％)、拟杆菌属(9.4％),两组在优势菌群的种类和所占比例不同。在B组中发现一类未知序列,而在A中未发现未知序列。