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猪圆环病毒3型(PCV3)是2015年发现的一个新型病毒,到目前为止PCV3在全球呈流行趋势,而患有繁殖障碍的母猪经常被该病毒感染,并且在患有某些疾病中可以检测的到该病毒,出现了共感染的现象。PCV3对全球的养猪产业造成了一定的经济损失,并且到目前为止PCV3无法在传代细胞中进行分离培养。为了减少PCV3对我国养猪产业造成的经济损失,并对其致病机理的研究提供支持,本研究利用河北株(GenBank登录号:MK105924)PCV3的全基因组序列构建感染性克隆,并将其转染到传代细胞中进行增殖。对河北株和全球的PCV3基因组进行序列分析,以进一步了解该病毒的结构特征、致病机理及其分布与地域之间的关系,为该病的防控提供理论基础。在华北地区采集到的病料中,发现了一株新的PCV3毒株。为了扩增这株新PCV3毒株的整个基因组序列,利用两对引物对其进行扩增,将所得到的产物进行基因组的序列测定后,获得了 PCV3的全基因组序列,并将其命名为河北株PCV3。对这一全基因组序列构建感染性克隆,获得了重组质粒,将构建的重组质粒转染到PK-15细胞中,并连续传15代。绘制了河北株的基因图谱,选取9株河北省PCV3毒株,将这10个基因组进行对比分析,利用软件分析遗传进化关系并绘制基因进化树,将截止到2019年GenBank上发表的全球176株毒株也进行上述分析。河北株Cap蛋白的基因型为3b亚型,与河北省其他株PCV3 Cap蛋白的同源性在97.8%-99.8%之间。所获得的河北株PCV3与PCV1和PCV2的全基因组序列同源性均低于50%,通过遗传进化树分析这三种PCV分别处于不同的分支,由此表明三者分别属于不同的基因型。与国内外其他43株PCV3全基因组序列的同源性在98.7%-99.3%之间,同源性最高的可达到99.3%,这是一株来自与俄罗斯的PCV3毒株(GenBank登录号:MG679916),二者亲缘关系最近,由此看出不同PCV3毒株之间的全基因组序列的同源性很高,同时尚未发现明显的变异。对全球175株PCV3全基因组序列的遗传进化分析发现,全球PCV3的数量和亚型的分布与地域有关。结论:发现了一株新的PCV3毒株(GenBank登录号:MK105924),且该毒株为3b亚型;成功构建了 PCV3感染性克隆,并连续增殖15代;全球PCV3及其亚型的分布存在地域的差异。