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目的：医学论文绩效评估,是医学科研管理的重要内容之一.该研究旨在针对综合医院的特点探讨应用文献计量学指标评估医学论文绩效的方法,初步构建国内医学期刊影响因子库,对医学论文、引文及论文绩效做出更加科学、合理、综合的动态评估,激励医院内基础研究人员及临床医师在基础实验及临床医学研究领域取得科研成绩和效益.方法：该研究在参考国内外有关论文绩效评估工作的基础上,认为有必要从论文发表和被引两个方面来综合评估论文绩效.以期刊影响因子（IF）作为考察论文及引用质量的指标,应用布拉德福区域分析法对中国科技论文与引文数据库（CSTPCD）中的医学期刊在各分支学科的基础上划分层次.296种国内医学期杆被划分为3个层次,各层次医学期刊IF的分布基本符合布拉德福定律中的离散现象,即期刊IF的离散程度体现了其重要程度.依据各层次期刊的IF均值,对分布于相应层次期刊上的论文和引用赋予分值.采用专家咨询法确定医学论文绩效评估中论文发表权重与被引权重.在此基础上提出医学论文绩效综合评估方法,并应用该方法对中日友好医院1995年～1999年间的论文发表及被引情况进行试评估（数据源自CSTPCD 2001光盘版）.利用累计百分比法确定论文综合绩效的核心科室及作者,并与传统评估方法产生的重点科室进行比较.结论：分析结果表明,该评估方法既能反映基础研究人员和临床医师论文绩效的主要方面,而且评估指标均为数据库源生指标、便于收集进行分析评估.指标客观,具有较好的科学性、可靠性,接受性强、易操作性好.该评估方法优于传统的评估方法.从研究的整体来看,该次研究的结果和数据资料是可靠的,基本达到了研究的设计要求,可以作为综合医院内基础研究人员及临床医师论文绩效评估的初步建议性方法.该研究认为对于论文评估应持发展的态度,可进一步完善医学期刊影响因子库,使论文、引文及论文绩效的评估处于动态变化中,为医院的科研管理和决策、重点学科及学科带头人的选拔等提供依据,以便进行动态的科研管理.