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伴随时代变革，创新成为产业发展主要驱动力，国家不断加大产业自主创新支持力度。高技术产业在国民经济体系中具有重大战略意义和突出带动作用，因此其发展得到国家重点支持。为实现产业的持续创新，需要创新范式的变革，引入创新生态系统能够解决高技术产业所面临的创新主体关联不够紧密、创新资源配置不够合理、创新活动效率不高、创新能力提升缓慢等问题。因此，发展高技术产业创新生态系统作为国家创新驱动发展战略的重要组成部分，既是提升国家整体创新水平的关键因素，也是提升创新效率的有效保障。
首先，从高技术产业创新现状出发，基于系统理论对对高技术产业创新生态系统内涵进行界定，并对系统要素进行分析，设计了高技术产业创新生态系统框架模型。其次，从高技术产业创新生态系统特征切入，对高技术产业创新生态系统运行过程进行剖析，设计由共生机制和进化机制构成的高技术产业创新生态系统运行机制。再次，对高技术产业创新生态系统共生特性界定、共生结构分析和共生效应进行揭示。从共生伙伴选择、共生利益分配、共生体系治理三个子机制总体设计共生机制，应用演化博弈方法和仿真方法对高技术核心企业和共生主体间关系以及政府第三方治理体系进行了分析。进而，从系统进化内涵与特征出发，提炼出高技术产业创新生态系统进化路径，设计进化机制。对进化内生动力和外生动力进行分析，构建进化动力机制；从创新学习、创新催化和创新涌现三个方面描述进化成长机制；采用传染病传播模型对高技术产业创新生态系统的进化扩散机制进行研究；建立市场双寡头模型探析高技术产业创新生态系统进化追逐机制。
然后，对高技术产业创新生态系统运行效率评价体系进行构建。基于效率内涵对共生阶段效率和进化阶段效率的评价方法进行选择，从投入因素、产出因素和影响因素三个维度构建高技术产业创新生态系统共生阶段效率和进化阶段效率评价指标体系。分别基于SFA方法和DEA方法构建共生阶段效率和进化阶段效率评价模型，形成完整的高技术产业创新生态系统运行效率评价体系。接着，对国家级高新区创新生态系统运行效率进行实证研究。计算我国30地区高技术产业创新生态系统运行共生阶段效率及其影响因素，分析影响规律，对共生阶段效率进行评价；对高技术产业创新生态系统进化阶段中间产出效率和最终产出效率及影响进化阶段效率因素进行计算与分析，分析影响规律，对进化阶段效率进行评价。
最后，基于对我国高技术产业创新生态系统运行效率计算结果分析，构建了提升高技术产业创新生态系统运行进化阶段效率的策略集；从宏观层面、中观层面和微观层面三个维度对高技术产业创新生态系统运行保障措施进行设计。
首先，从高技术产业创新现状出发，基于系统理论对对高技术产业创新生态系统内涵进行界定，并对系统要素进行分析，设计了高技术产业创新生态系统框架模型。其次，从高技术产业创新生态系统特征切入，对高技术产业创新生态系统运行过程进行剖析，设计由共生机制和进化机制构成的高技术产业创新生态系统运行机制。再次，对高技术产业创新生态系统共生特性界定、共生结构分析和共生效应进行揭示。从共生伙伴选择、共生利益分配、共生体系治理三个子机制总体设计共生机制，应用演化博弈方法和仿真方法对高技术核心企业和共生主体间关系以及政府第三方治理体系进行了分析。进而，从系统进化内涵与特征出发，提炼出高技术产业创新生态系统进化路径，设计进化机制。对进化内生动力和外生动力进行分析，构建进化动力机制；从创新学习、创新催化和创新涌现三个方面描述进化成长机制；采用传染病传播模型对高技术产业创新生态系统的进化扩散机制进行研究；建立市场双寡头模型探析高技术产业创新生态系统进化追逐机制。
然后，对高技术产业创新生态系统运行效率评价体系进行构建。基于效率内涵对共生阶段效率和进化阶段效率的评价方法进行选择，从投入因素、产出因素和影响因素三个维度构建高技术产业创新生态系统共生阶段效率和进化阶段效率评价指标体系。分别基于SFA方法和DEA方法构建共生阶段效率和进化阶段效率评价模型，形成完整的高技术产业创新生态系统运行效率评价体系。接着，对国家级高新区创新生态系统运行效率进行实证研究。计算我国30地区高技术产业创新生态系统运行共生阶段效率及其影响因素，分析影响规律，对共生阶段效率进行评价；对高技术产业创新生态系统进化阶段中间产出效率和最终产出效率及影响进化阶段效率因素进行计算与分析，分析影响规律，对进化阶段效率进行评价。
最后，基于对我国高技术产业创新生态系统运行效率计算结果分析，构建了提升高技术产业创新生态系统运行进化阶段效率的策略集；从宏观层面、中观层面和微观层面三个维度对高技术产业创新生态系统运行保障措施进行设计。