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背景食管癌(esophageal cancer,EC)是一种高度恶性的消化道肿瘤,其发病率居所有恶性肿瘤的第8位。虽然目前食管癌的治疗方法得到优化,但5年生存率仍只有10-20%。研究发现食管癌的发生、发展是由多因素作用、多基因变化先后积累的结果,但其具体的发病机制仍不完全明确。因此更好的阐明EC的生物学行为,了解其发病机制对发展高效、特异性强的诊断方法和治疗策略及提高EC术后生存率具有重要意义。长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸而无蛋白质编码功能的RNA分子,进化上高度保守,可以通过多种途径调控基因的表达,在机体生长发育、细胞增殖、细胞凋亡、激素分泌和肿瘤形成等多个环节起着重要的作用。越来越多研究证明,lncRNA的表达及功能异常与多种恶性肿瘤的发生、发展密切相关,在肿瘤发生过程中类似癌基因或抑癌基因的作用。目的查阅文献发现与食管癌发生、发展等病理生理过程相关的lncRNA的研究目前较少。因此,本课题拟通过高通量基因芯片检测食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)中lncRNA表达谱,进一步筛选并验证食管鳞癌中相关的特异性lncRNAs,从而确定食管鳞状细胞癌的靶基因,为后期实验揭示lncRNA在食管鳞癌的发病机制奠定基础,同时为食管癌早期诊断、预后判断及新的治疗策略提供思路。方法利用Human Lnc RNAArray v3.0生物芯片检测并比较5对食管鳞癌及癌旁正常组织标本的lncRNA表达谱,筛选出ESCC中异常表达的lncRNAs;通过分析比较并结合文献报道,从45个候选lncRNAs中选定12个进行初步分析,运用q RT-PCR方法在5对相同的ESCC及癌旁组织标本中初步验证了HOXA11-AS、LINC00467、GAS5、SACS-AS1等4个异常表达的lncRNAs;最后在42对ESCC及癌旁组织标本中进一步验证上述4个异常表达的lncRNAs的表达水平,确认与ESCC组织相关特异的lncRNAs;同时分析基因与食管鳞癌患者临床病理特征之间的关系。结果芯片研究结果提示食管鳞癌组织与癌旁正常组织相比表达上调的lncRNAs有1607个而表达下调的有2099个。经5对样本q RT-PCR验证及结合文献分析,找到4个具有研究价值的异常表达的lncRNAs,结果发现lncRNAs LINC00467和HOXA11-AS、GAS5在食管鳞癌中表达水平增高,而SACS-AS1在食管鳞癌中的表达水平下降。而我们的42对样本q RT-PCR验证数据表明高表达的lncRNA HOXA11-AS在食管鳞癌组织中的表达阳性率高于癌旁组织,差异具有统计学意义(P<0.05);而低表达的SACS-AS1在食管鳞癌组织中的表达阳性率高于癌旁正常组织,差异具有统计学意义(P<0.05),验证结果与基因芯片的结果相符。同时其相对表达水平与食管鳞状细胞癌的临床分期、肿瘤的部位、肿瘤细胞分化程度及有无淋巴结转移有关(P<0.05),而与患者的年龄、性别无关(P>0.05)。结论我们首次发现与癌旁正常组织相比,lncRNA HOXA11-AS在食管鳞癌中的表达水平升高,而SACS-AS1的表达水平下降,与基因芯片结果基本一致;同时其相对表达水平与食管鳞癌的临床分期、肿瘤部位、肿瘤细胞分化程度及有无淋巴结转移有关,而与患者的年龄、性别无关。因此lncRNA HOXA11-AS和SACS-AS1异常表达可能与食管鳞癌的发生发展有关,预示这两种基因可能是食管鳞癌新的治疗靶点。