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目的:本课题旨在研究寻常痤疮患者与健康对照相比,其肠道菌群丰富性及宿主-肠道共代谢产物的差异,并对差异菌群进行功能分析,初步探讨肠道菌群参与痤疮发病的机制。方法:采集43名寻常痤疮病人和43名年龄、性别匹配的健康对照组的粪便标本。采用商品化试剂盒QIAamp DNA Stool Mini Kit进行粪菌脱氧核糖核酸(DNA)提取纯化,利用Thermo NanoDrop 2000紫外微量分光光度计定量和1%琼脂糖凝胶电泳对总DNA进行质量检验。采用试剂盒Ion 16S?Metagenomics Kit及SimpliAmp thermal cycler平台进行16srDNA基因v3-v4区域序列扩增。扩增引物(primer)为:F341F(5’-ACTCCTACGGGRSGCAGCAG-3’)和R806R(5’-GGACTACVVGGGTATCTAATC-3’)。采用Ion Plus fragment Library kit构建DNA文库。采用Hiseq平台,对纯化扩增的16srDNA序列进行测序。粪菌样本的物种丰富度采用Alpha多样性分析,包括shannon指数、simpson指数。两组间菌群组成差异采用β多样性、PCOA主坐标分析、MRPP组间差异分析和Heatmap聚类分析。两组差异菌群采用LefSe层次聚类分析,线性判别分析,LDA值>2有统计学意义,同时应用wilcox.test和kruskal.test分别在门、纲、目、科、属水平对差异细菌进行检验,P<0.05具有统计学意义。基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库对差异基因进行功能注释,利用PICRUSt和STAMP软件平台,预测基因功能构成。采用Agilent7890B型气相色谱仪对145种代谢产物进行定量分析,非参数检验比较两组代谢产物差异。结果:研究显示,寻常痤疮患者与健康对照组相比肠道微生物丰富性明显下降(Shannon多样性指数(P=0.009),Simpson多样性指数(P=0.01))。PCOA分析显示痤疮患者与健康对照的操作分类单元(OUT)呈分离趋势。MRPP分析提示痤疮与健康对照肠道菌群组成差异明显(P=0.034)。LefSe层次聚类分析发现,寻常痤疮组与健康对照组中共有38种差异细菌,(log LDA值>2)。非参数检验对以上38种差异细菌进行了验证,P值均小于0.05。在门的水平上,厚壁菌门丰度减低,拟杆菌门丰度增高。属水平的19种差异细菌如气球菌属、嗜碱菌属、芽孢杆菌属、嗜胆菌属、布劳特氏菌属、瘤胃球菌属等,其丰度均较健康对照组降低。基于KEGG的功能分析显示在通路水平,痤疮组脂多糖(LPS)生物合成增加。ATP结合盒(ABC)转运蛋白通路下调(LDA值均大于2)、免疫疾病相关代谢及氨基酸代谢途径明显上调。代谢产物分析显示:粪菌145种代谢产物中有24种代谢产物差异明显(P值<0.05)。寻常痤疮患者代谢产物中组氨酸、亮氨酸、苯基丙氨酸、色氨酸、酪氨酸、缬氨酸、甘氨酸、天(门)冬氨酸均高于健康对照组。结论:1.与健康对照组相比,寻常痤疮患者存在肠道菌群失调。2.寻常痤疮患者与健康对照组比较,宿主-肠道共代谢产物差异明显。3.寻常痤疮患者肠道差异菌群与LPS生物合成、ABC转运蛋白等代谢通路等关系密切,为下一步菌群参与痤疮发病机制的研究指明了方向。