春兰内生细菌群落多样性及功能菌株筛选

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本研究将培养方法和构建16S rDNA克隆文库的方法相结合,研究了野生春兰根内生细菌的群落多样性,并从本实验室分离到的春兰内生细菌中筛选产铁载体和拮抗植物病原菌的功能菌株。从野生春兰根内分离到了63株内生细菌,通过扩增rDNA限制性分析(ARDRA)和16S rDNA序列对其可培养细菌群落多样性进行了研究。分析结果显示:63株内生细菌分属于变形菌门的β-变形菌纲(31.75%)、γ-变形菌纲(7.94%)和厚壁菌门(60.31%)的5个属,最优势菌属为芽孢杆菌属。1个菌株可能为新属或新种。构建了野生春兰根内生细菌16S rDNA克隆文库。16S rDNA克隆文库测序结果表明:188个克隆分别属于变形菌门的α-变形菌纲(5.85%)、β-变形菌纲(63.30%)、γ-变形菌纲(7.98%)和δ-变形菌纲(1.06%);拟杆菌门(9.57%)、厚壁菌门(4.79%),放线菌门(1.60%)、酸杆菌门(0.53%)、门未定的纤线杆菌纲(1.06%),还有8个克隆未确定类群。变形菌门(78.19%)为最优势类群,伯克霍尔德氏菌属为最优势菌属。将培养方法和文库构建方法的结果相比较,发现克隆文库获得的群落结构信息更加丰富。采用CAS检测法从春兰根内生细菌中筛选到了47株可产铁载体的功能菌,并结合16S rDNA系统发育分析对可产铁载体内生细菌多样性进行了研究。结果表明:这47株可产铁载体内生细菌分属于变形菌门的α-变形菌纲(17%)和β-变形菌纲(23.4%)、厚壁菌门(17.0%)、放线菌门(42.6%)的17个属。最优势菌属为芽孢杆菌属和贪噬菌属,并且贪噬菌属为高产铁载体的主体菌属。还有2个菌株可能为新属或新种。这些结果揭示春兰根内可分泌铁载体的内生细菌具有丰富的多样性,17个属中的类诺卡氏菌属、拟诺卡氏菌属、Solirubrobacter、Sphingopyxis、Pannonibacter、Alterierythrobacter等6个属的细菌还未见其可产生铁载体的报道。通过平板拮抗法从459株春兰内生细菌中筛选出了1株对胶孢炭疽菌具有强拮抗作用的菌株。经过形态学观察和生理生化分析以及16S rDNA序列测定鉴定该菌株gt19-1为枯草芽孢杆菌。对gt19-1的无菌发酵液和粗提蛋白进行了胶孢炭疽菌抑菌活性的测定,无菌发酵液和粗提蛋白都具有抑菌作用,而发酵液中是否还有其他抑菌物质还需要进一步的研究。温室盆栽防效试验结果表明菌株gt19-1对辣椒炭疽病有一定的抑制作用,防效达到了22%。
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