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农业产业化经营是农业现代化的重要内容，对于我国农村经济社会发展和广大农民的未来具有重大意义，其影响深远是新中国以来发生的农业变革所不能与之相比拟的。然而，目前，我国农业产业化经营组织却存在很多问题，包括松散的利益联结机制、农户和企业之间不稳定的契约关系，这些都是我国当前农业产业化经营组织存在的通病。而2008年的“三鹿奶粉”事件更是给我们敲响了警钟，因此，有必要寻求更适合我国农村经济环境的农业产业化经营组织模式，并且通过相关制度安排来促进向该模式的自发演进。
发达国家的农业产业化经营已经有很长一段时间的历史了，其发展农业产业化经营组织的成功经验对我国有很大的借鉴意义。根据发达国家的成功经验，未来我国农业产业化经营组织模式将会是农工商综合体和专业合作社这两种模式。
农业产业化经营组织制度创新包括对农业产业化经营组织模式进行创新和对组织所处农村经济制度环境的创新，本文将前者界定为内部制度创新，而后者为外部制度创新。本文侧重于对农业产业化经营组织内部制度和外部制度创新研究，通过农户与企业之间利益博弈模型分析了当前农业产业化经营组织存在问题的根本原因，结合这些原因以及国外经验，得出未来农业产业化经营组织模式演进方向为专业合作社模式和农工商综合体模式的结论，向新的组织模型过渡必然需要新的制度安排，本文最后一部分便是对新的制度安排提出创新方向以及政策建议。