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化肥是造成农村环境恶化的主要成因之一，然而化肥对粮食生产的不可替代的贡献率以及粮食安全的重要性注定化肥在相当一段时间内不可能淡出市场。本文在分析化肥施用带来的农村环境问题和粮食质量安全问题、粮食增产的重要性、化肥对粮食增产不可替代的贡献率、以及化肥与农民收入关系之间的矛盾的基础上，对比分析了农田产量与化肥投入的两种拟合方程，对当前我国化肥有利性进行评价，结合化肥的贡献率、化肥对环境的染污和化肥的使用成本划分了化肥有效使用区域，并建立了化肥有效性评价指标。
基于对我国目前化肥施用现状的分析和对农村与化肥生产企业的实地调查，并借鉴不同经济发展状态下环境政策的演化趋势和国外相关经验，提出了两种提高化肥有效性的解决方案。方案一分析了解决环境外部性问题的主要思路一环境税在合理调整化肥施用量上的应用，方案二根据所划分的化肥使用的不同区域分别制定不同的政策，并按照各区域不同的着重分析了化肥使用低效区的解决政策，提出了绿色化肥协会的建立方案和绿色化肥评估体系的要求。
在目前我国现有状态下，征收化肥税收差别虽有其不可比拟的优点，但从农民的经济能力和化肥生产企业的状况出发分析，按化肥施用的不同区域分别制定不同的政策更为实用。