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硫代葡萄糖甙（简称硫甙，Glucosinolate）是十字花科重要的一种次生代谢产物，是白菜类作物（Brassica campetris syn. rapa,2n=20）中的重要营养物质成分。但是，直接测定硫甙含量费时费力，在育种过程中不宜直接选择。有必要在分子水平上对硫甙含量和不同组分的变异特点进行研究，从而能够进一步发掘优异基因资源。本研究根据大白菜基因组序列信息，针对大白菜硫甙合成相关的所有基因开发特异SSR位点，分析其重复类型和分布特点；结合开发出的分布于全基因组水平的InDel标记，分析在75份不同类型的大白菜自交系中扩增的效果和多态性水平；通过HPLC（高效液相色谱）方法分别在苗期（定植后35天）和成熟期（适宜采收期）测定叶片硫甙含量，解析其变异特点；通过关联分析，获悉与大白菜硫甙含量相关的SSR等位基因或位点及InDeL标记。为分子标记辅助选择育种提供基础材料，加快大白菜营养品质育种的进程。主要研究结果如下：1.比对拟南芥和大白菜硫甙生物合成相关基因的序列信息，发现拟南芥的52个硫甙合成基因在大白菜中的同源基因个数分别为：零拷贝基因8个、单拷贝基因13个、2拷贝基因17个、2个以上多拷贝基因14个。2.根据102个大白菜硫甙生物合成相关基因的上下游序列各5kb，共开发出237个SSR位点：16个基因没有发现SSR位点，72个基因存在1~4个SSR位点，5个基因存在5个SSR位点，4个基因存在6个SSR位点，4个基因存在7个SSR位点，1个基因存在8个SSR位点；所开发的SSR位点中，共发现4种重复类型，其中单核苷酸重复最多，共122个，占SSR总数的51.4%。其次是二核苷酸类型，共48个，占SSR总数的20.3%。三核苷酸重复类型最少，共7个，占SSR总数的3.0%。另外60个SSR无明显的重复类型。3.具有SSR位点的86个基因中，77个基因可以设计特异SSR引物。其中，49对特异引物在大白菜自交系中得到有效扩增，16对引物具有多态性，占全部引物的20.8%；18对引物无多态性，占全部引物的23.4%；15对引物杂带多，占全部引物的19.5%；另外28对引物无扩增产物，占全部引物的36.4%。最终，11对在供试的75份材料中获得了清晰多态性扩增产物，共检测出26个等位基因，平均每对引物检测到等位基因2.4个。4.开发设计的177对InDel引物，161对在供试的75份大白菜自交系中得到有效扩增，占全部引物的91.0%；61对获得了清晰多态性扩增产物，占全部引物的34.5%；61对引物共检测到161个多态性带，平均每对引物检测到2.6条带。其中，95对引物只检测到1条扩增带，31对检测到2条扩增带，24对检测到3条扩增带，6对检测到4条扩增带。5.在苗期，测定了68份大白菜自交系的叶片硫甙含量。结果表明不同基因型间各硫甙间含量差异较大，总硫甙含量变异幅度为0.734-11.189μmol/g DW；吲哚族硫甙平均含量高于脂肪族硫甙和芳香族硫甙，所占比例分别为49.9%、39.8%和10.6%。其中，３-吲哚-甲基硫甙（GBC）含量最高，占总硫甙含量的27.0%；４-甲氧基-３-吲哚甲基硫甙（4ME）和4-戊烯基硫甙（GBN）含量较高，分别占总硫甙含量的18.0%和15.9%；４-羟基-３-吲哚-甲基硫甙（4OH）含量最低，仅占硫甙总含量的0.6%。6.在成熟期，测定了68份大白菜自交系的叶片硫甙含量。结果表明不同基因型间各硫甙间含量差异较大，总硫甙含量变异幅度为1.918-17.357μmol/g DW；脂肪族硫甙和吲哚族硫甙的平均含量高于芳香族硫甙，所占比例分别为48.6%、41.7%和9.7%。其中，2-羟基-3-丁烯基硫甙（PRO）、4-戊烯基硫甙（GBN）、４-甲氧基-３-吲哚甲基硫甙（4ME）和３-吲哚-甲基硫甙（GBC）含量相当，分别占总硫甙含量的19.8%、19.7%、19.6%和19.0%。４-羟基-３-吲哚-甲基硫甙（4OH）含量最低，仅占硫甙总含量的0.7%。成熟期总硫甙和各个成分含量明显高于苗期，相差约2倍。7. GLM关联分析表明，以统计概率P值0.01为标准，共检测到与硫甙含量关联的SSR和IDENL分子标记97个，分布在大白菜10个连锁群中。检测到的连锁标记大多数与4OH、NAP、GBN相关。