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目的
探讨乙型肝炎病毒相关性肝细胞癌(HBV-related HCC)与慢性乙型病毒性肝炎(CHB)患者差异表达的circRNAs。
方法
从4例乙型肝炎病毒相关性肝细胞癌(HBV-related HCC)患者和4例慢性乙型病毒性肝炎(CHB)患者(对照)中收集外周静脉血样本。分离纯化的总RNA,并使用高通量测序技术确定两组中的circRNAs表达谱。对具有差异表达的circRNAs进行了生物信息学分析。定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)用于验证其他6例患者(3例CHB和3例HBV-relatedHCC)的这些结果。
结果
circRNAs高通量测序的数据清楚地表明,两组中有14,460个circRNA具有显著不同的表达(p<0.05)。乙型肝炎病毒相关性肝细胞癌患者与慢乙肝患者相比,存在hsa_circRNA_0072330,hsa_circRNA_0017153,hsa_circRNA_0052836显著上调,hsa_circRNA_0073472和hsa_circRNA_0006671显著下调的情况。其他6例患者的qRT-PCR验证了这些结果。
结论
我们通过对CHB患者与HBV相关性HCC患者的比较表明,HBV相关性HCC患者有许多差异表达的circRNAs。这些circRNAs有可能作为早期诊断HCC的新生物标志物,并作为HBV相关性HCC临床治疗的潜在靶标。
探讨乙型肝炎病毒相关性肝细胞癌(HBV-related HCC)与慢性乙型病毒性肝炎(CHB)患者差异表达的circRNAs。
方法
从4例乙型肝炎病毒相关性肝细胞癌(HBV-related HCC)患者和4例慢性乙型病毒性肝炎(CHB)患者(对照)中收集外周静脉血样本。分离纯化的总RNA,并使用高通量测序技术确定两组中的circRNAs表达谱。对具有差异表达的circRNAs进行了生物信息学分析。定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)用于验证其他6例患者(3例CHB和3例HBV-relatedHCC)的这些结果。
结果
circRNAs高通量测序的数据清楚地表明,两组中有14,460个circRNA具有显著不同的表达(p<0.05)。乙型肝炎病毒相关性肝细胞癌患者与慢乙肝患者相比,存在hsa_circRNA_0072330,hsa_circRNA_0017153,hsa_circRNA_0052836显著上调,hsa_circRNA_0073472和hsa_circRNA_0006671显著下调的情况。其他6例患者的qRT-PCR验证了这些结果。
结论
我们通过对CHB患者与HBV相关性HCC患者的比较表明,HBV相关性HCC患者有许多差异表达的circRNAs。这些circRNAs有可能作为早期诊断HCC的新生物标志物,并作为HBV相关性HCC临床治疗的潜在靶标。