云南省几种作物及杂草上双生病毒及伴随的DNAβ的分子鉴定

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双生病毒是一种呈孪生颗粒形态的植物单链环形DNA病毒,至今已在多个国家和地区的多种作物上造成毁灭性危害。自20世纪90年代起,我国华南等省作物上双生病毒病害逐年加重。本文对云南省几种作物和杂草上的双生病毒进行了分子鉴定。 从云南烟草、番茄、刺茄、胜红蓟、赛葵和豨硷上共采集了40个双生病毒样品,用双生病毒的简并引物扩增了病毒基因组部分序列,序列测定表明,40个双生病毒样品可分为四大类:Y231、Y238、Y240、Y241、Y244、Y248、Y261、Y262、Y263、Y264、Y265、Y266、Y268、Y295、Y296、Y297、Y298、Y318、Y319、Y320、Y321、Y322、Y323和Y324等24个分离物属于中国番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl China virus,TYLCCNV);Y288、Y289、Y291和Y315等4个分离物属于烟草曲茎病毒(Tobacco curly shoot virus,TbCSV);Y290、Y309、Y310、Y311、Y314、Y316和Y317等7个分离物属于云南烟草曲叶病毒(Tobacco leaf curl Yunnan virus,TbLCYNV);Y304、Y305、Y306、Y307和Y308等5个分离物属于云南赛葵黄脉病毒(Malvastrum yellow vein Yunnan virus,MYVYNV)。 Y322分离自云南砚山刺茄(Solanum aculeatissimum),全序列测定表明,Y322 DNA-A全长2730个核苷酸,共编码6个ORF。基因组比较发现,Y322 DNA-A与中国番茄黄化曲叶病毒(TYLCCNV)各分离物的同源性最高(88.3%~99.2%),而与其它双生病毒的同源性均在79.6%以下,表明Y322是TYLCCNV的一个分离物。利用DNAβ的特异性引物在Y322中扩增到全长为1331个核苷酸的DNAβ分子(Y322β),Y322β的全序列与TYLCCNV伴随的DNAβ的同源性最高,达93.1%,而与已报道的其它种类的DNAβ的同源性均低于55.4%。这是首次报道中国番茄黄化曲叶病毒可侵染刺茄。 测定了分离自烟草的Y231、Y244和分离自番茄的Y295的全基因组DNA-A。序列比较表明,Y231和Y244之间的同源性高达99.4%,它们与TYLCCNV-[Y64]的同源性最高,分别为99.6%和99.2%;Y295与
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