【摘 要】
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本文针对基因调控网络离散模型中的自动机模型进行深入研究,将自动机模拟基因间相互调控关系的思路从一阶逻辑拓展到高阶逻辑。设计出二阶和三阶的调控自动机,并把这些设计分
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本文针对基因调控网络离散模型中的自动机模型进行深入研究,将自动机模拟基因间相互调控关系的思路从一阶逻辑拓展到高阶逻辑。设计出二阶和三阶的调控自动机,并把这些设计分拆成元件,以便拓展到更高阶逻辑。一旦完善了自动机模型,我们可以对任意基因调控网络建立自动机网络模型与之对应。
我们利用结肠癌关键基因的表达谱数据,依据LAPP方法寻找关键基因的一阶与二阶逻辑关系,并建立关键基因的调控网络。从我们建立的调控网络中取出一个典型网络做模拟和分析。我们提出一套思路,可以发现这个网络具有的不同的分支和稳态,从而建立人工调控机制,使得基因网络的状态在不同分支和稳态间跳跃。这将为基因疾病的网络模式的诊断与治疗提供新的研究方法。
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