粳稻秀水79背景的C堡染色体片段置换系构建和穗长qPL9-2的精细定位

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水稻是世界三大主要粮食作物之一,同时也是中国人民最主要的主食之一。随着中国人口的增加,城市化和工业化的发展,以及人们对食物品质的要求,使得培育优质高产的水稻品种成为解决日益严峻的粮食危机的必不可少的途径。亚洲栽培稻有两个亚种,分别为籼稻和粳稻。在中国,目前粳稻产量比籼稻产量每公顷可高17%,直立穗和半直立穗品种的选育和应用是粳稻产量提高的主要原因。穗长与稻穗弯曲度密切相关,是重要的产量构成性状。深入研究穗长性状形成的内在遗传机制,有助于根据育种目标塑造穗部形态。染色体片段置换系(CSSL)与背景亲本相比,仅在置换片段上存在差异,具有单一性、稳定性以及可分割性,是对数量性状基因位点进行染色体区段精细定位的优良遗传材料。为此,本论文进行了以下两项研究:一是在前人获得的粳稻秀水79/C堡//秀水79组合的BC3F1群体基础上,利用分子标记辅助选择,经过连续回交和自交,构建秀水79背景的C堡染色体片段置换系群体,为发掘粳稻产量相关性状有利等位基因创制遗传群体;二是对前人利用该组合RIL群体定位到的控制穗长性状的新的主效(贡献率34.1%)QTLqPL9-2,利用上述群体中目标基因位点杂合的单株,通过单片段分离群体对其所在染色体区段进行精细定位。获得的主要研究结果如下:1.构成了一套由58个渐渗系组成的秀水79背景C堡染色体片段置换系(XC-CSSL)群体。XC-CSSL群体置换片段共覆盖了供体C堡全基因组的94.44%。58个染色体片段置换系中,携带1个供体片段的代换系有6个,携带2个供体片段的有11个,携带3个供体片段的有15个,携带4个供体片段的有6个,携带5个供体片段的有8个,携带6个供体片段的有3个,携带7个供体片段的有6个,含有9、10和12个供体片段的代换系各1个。2.将控制粳稻穗长的主效QTL qPL9-2精细定位至第9染色体长臂InDel标记LY1504和SSR标记RM7289之间的90kb范围内。LY1504和RM7289构成的物理区间内含有 7 个候选基因LOCOs09g457100、LOCOs09g456900、LOCOs09g456800、LOCOs09g456700、LOCOs09g456200、LOCOs09g456100、LOCOs09g455900(http//www.ncbi.nlm.nih.gov)根据基因功能注释,推测LOCOs09g456900为qPL9-2位点的候选基因。
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