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湿地是自然界生物多样性和生产力较高的生态系统，由于湿地特殊的水文条件，湿地生态系统易受自然及人为活动干扰的破坏，使湿地生态系统的功能部分甚至全部丧失，生物多样性减少，系统生态功能受损，富营养化越来越严重，不仅直接造成重大的经济损失，也有损区域经济的可持续发展能力。本文首先回顾了湿地生态系统健康的概念、影响其健康的因素、以及湿地健康评价指标的选择和评价方法等。之后以江苏省宿迁市骆马湖和宜兴市太湖的一条入湖河道林庄港为例，在空间和时间尺度上对湿地健康进行了研究。
湖泊作为典型的湿地类型，自净能力的研究对于湖泊健康研究具有重要意义。位于江苏北部京杭运河沿线的骆马湖，是典型的过水性湖泊，是中国南水北调东线工程必经之地，既对当地也对我国北方部分省区有重要影响，近些年来，由于湖区水产养殖及外源污染物的输入，水质已处于中等富营养化阶段，污染事故时有发生。
本文根据在骆马湖设立的五个省控点(戴场、三场、嶂山闸、骆马湖乡、洋河滩闸，其中，戴场、三场监测点位于湖泊的中上部位置，靠近入湖河道河口，戴场周边同时也是骆马湖渔业养殖较密集的区域。嶂山闸、骆马湖乡和洋河滩监测点位于湖泊的出湖河道河口附近)的水质资料以及结合遥感判读、现场调查等方法，对过水性湖泊骆马湖1991-2003年湿地自净能力的变化趋势进行了研究。结果表明：1991-2003年，各采样点水质指标无显著变化，但出、入湖口水质差异显著，表明骆马湖目前尚有较强的自净能力；各采样点间主要水质指标的变异系数逐渐减小，表明湖泊对水体总氮、溶解氧、挥发酚、非离子氨、砷等主要富营养化和污染物指标的净化能力不断减小，湿地生态系统的自净能力显著下降。经比较，认为总氮、溶解氧等指标及部分外源污染物指标在不同采样点间的变异系数可作为湿地生态系统自净能力与健康状况的重要参考指标。
入湖河流是湖泊营养物质的一个重要来源，因此入湖河道水质的改善是控制湖泊富营养化的关键。河道作为另一种湿地类型，具有明显的季节性特点，雨季时节水量充分，其余时节则相对少一些。对于居民聚居地附近的河流，面源污染是影响它健康的主要原因。宜兴市大浦镇林庄港是和太湖连接的一条入湖河道，本文通过对林庄港2004.10-2005.9月一年的水质监测资料，对此河道一年的水质变化季节性变化规律进行了研究。结果表明：(1)河道全年总氮含量监测值均劣于Ⅴ类水指标，其它水质指标相当于Ⅱ-Ⅳ类水水质，水体的富营养化主要体现为总氮含量的超标；(2)除总氮、总磷，其余水质指标在植物的生长季均劣于非生长季； (3)水体中五日生化需氧量、高锰酸盐指数、叶绿素a含量的变化主要受温度的影响，温度变化是水体有机质含量变化的触发因子；(4)降雨量与水体总磷含量呈显著正相关，但对其它水质指标影响较小，说明水体生态过程对总磷的影响相对较小，总氮等指标更易受水体生态过程的影响。综上所述，全年河道水质总体较差，但是在8月到12月间水质较稳定，且要略好于其余时间段，在温度逐渐升高的1-6月份水质较差，随着温度的升高水体藻类含量增加，引起了一系列水体效应，导致水体富营养化的发生。