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随着社会的发展，科学技术的不断进步，竞争的日趋激烈，高等教育与社会之间存在了越来越为紧密的关系，高等学校的教育体制改革引起了社会各界的广泛关注。就外部力量而言，国家社会对学校的影响日趋增大，就内部结构而言，目前形成了多种力量共存于学校的内部的权力结构体系。 多种权力中，行政权力与学术权力作为高校内部治理结构的核心存在着。而两种权力的存在与发展也都有其合理性。作为纯粹的学术型组织，学术性是高校的基本属性，因此学术权力是其最基本的权力。但是随着高校规模的逐渐扩大，高校内部组织部门逐渐增多，要想确保学校的有序运转仅仅依靠学术权力是远远不够的，要想提高组织运行的高效性，必须科学合理的运用行政权力与学术权力进行校内事务管理，因此行政权力的存在也有其客观必然性。虽然行政权力与学术权力之间存在质的差异，但是在高校这样一个特殊的社会组织当中，必须合理使用两种权力，只有两种权力相互配合，取长补短才能从整体上促进高校的发展，实现其社会职能。 本文站在博弈的视角，为使两种权力之间形成一种合作博弈关系，结合我国高校的实际情况，应当进一步推动学术权力的发展，转变观念培养高校学术氛围；强化学术权力促进两种权力之间势均力敌关系的形成；横向实行学术事务和行政事务决策制约体制，纵向扩大院系权力是权力中心下移。通过这样的方式强化学术权力，相对弱化行政权力，为二者的合作博弈创造条件，进而推动高校的长期稳定健康发展。