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本文从产学研合作的概念、理论基础及模式入手，对产学研合作机制的内涵、要素和运行进行了阐释。通过论述特色高等学校发展现状，指出产学研合作是特色高等学校发展的必由之路。通过分析不同层次特色高等学校产学研合作的模式及现状，对不同层次特色高等学校产学研合作机制进行了研究。在此基础上，从机制运行的过程角度，构建了一个具有广泛应用意义的包括建立与行业部门联系新机制、利益分配机制、法律约束机制、管理机制、保障机制等方面相结合的灵活、有效的特色高等学校产学研合作机制。其中与行业联系新机制是前提，利益分配机制是核心，管理机制是关键，保障机制是基础。