太湖和近海养殖场沉积物细菌多样性的研究

来源 :中国科学院微生物研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaohengjun
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  本研究采用不依赖于分离培养直接构建16SrRNA基因文库、序列分析,不同浓度营养基质富集培养构建富集培养物16SrRNA基因文库、序列分析,以及不同浓度营养基质分离培养纯菌株并进行系统发育分析等方法,对太湖沉积物中的细菌多样性从多个方面进行了研究和表征。   研究结果表明,存在于不依赖分离培养构建的太湖沉积物细菌16SrRNA基因克隆文库(非培养文库)中的优势类群是β-变形细菌(Proteobacteria),所分析的84个克隆中有48个克隆属于该类群,其中的24个克隆序列与一株分离自稻田土壤的专性化能自养的氧化硫细菌5Z-C1的16SrRNA基因序列具有极高的相似性,该菌株与排硫硫杆菌(Thiobacillusthioparus)系统关系密切,不同浓度的营养基质对不同类群的细菌富集作用不同,对同一类群的不同属种的微生物也同样具有选择性;稀释与普通培养基相比,采用稀释培养基能从太湖沉积物中富集、分离获得更多属种的细菌,尤其是α-变形细菌类群的富集效果明显,所获得的新的细菌也更多。
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