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结核病是一种环境因素和基因因素共同作用的疾病。感染结核的种种不同临床表现反映了结核的致病性与宿主免疫反应之间的平衡。有研究表明,结核分支杆菌的一种细胞壁成分LAM的作用与革兰氏阴性菌细胞壁的脂多糖相似,能刺激机体产生多种细胞因子,诱发机体产生对抗结核菌的炎症反应,其中包括白细胞介素-1(interleukin-1,IL-1),其中IL-1 α、IL-1β是激动剂,与广泛存在的靶细胞表面IL-1受体结合,产生生物学效应。IL-1ra是IL-1 α、IL-1 β的拮抗剂,能与IL-1受体竞争性地结合,占据位置但不触发任何信号,从而发挥特异性抑制IL-1的活性。IL-1基因包含3个基因,IL-1A、IL-1B、IL-1RN。这三个基因均存在多个位点的突变,形成多个单核苷酸多态性(SNPs)。本研究以期了解IL-1B基因多态性与中国人群结核易感性的关系。
研究方法:
研究对象:对照组来自济南市中心医院健康查体中心,共65例,年龄从18-60岁,其中男29例,女36例。所有对照经胸部X线排除结核病史,无自身免疫病、慢性炎症等其他疾病。病例组:按国家统一诊断标准选择山东省胸科医院结核病例,共98例。所有病例经痰菌涂片、培养、结核菌素试验和X线或CT确诊,同时排除相似病症及自身免疫病、慢性炎症等其他疾病。
方法:
1.白细胞介素-1B基因多态性的检测用基因芯片法和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)两种方法对照分析。对照组和病例组每例采集2ml静脉
血加入EDTA抗凝管中,-20℃冰冻保存,备用。
(1)基因芯片法:样品经DNA提取、PCR扩增,然后与芯片在杂交舱中杂交、显色,然后烘干后,在Baio BE基因芯片检测仪上进行扫描测定,由软件自动判断并输出结果。
(2)聚合酶链反应一限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析: 用改良碘化钠法<[17]>提取DNA。经PCR扩增,然后用特异的限制性内切酶Ava I消化IL-1B-511基因PCR产物,用特异的限制性内切酶Alu I消化基因PCR产物,产生相应的特异性等位基因片段,酶切产物用3%琼脂糖凝胶电泳,GDs800凝胶成像及分析系统对染色后的凝胶进行照相并保存。
2.白细胞介素-1RN基因多态性的检测:
样品经PCR扩增,产物用2%~3%琼脂糖凝胶电泳检测(用100bp的ladder)。
结果:
1、经统计分析,IL-1B-511各基因型CC、CT、TT在对照组中和病例组出现的频率没有显著性差异,说明两组基因型分布没有不同。等位基因IL-1B-511C和IL-1B-511T在对照组和病例组中的分布没有显著不同。IL-1B-511等位基因T在肺结核组分布频率高于肺外结核组。IL-1B-511各基因型CC、CT、TT携带者在非空洞肺结核与空洞肺结核组出现的频率比较,两组比较有显著性差异,说明两组基因型分布不同,携带TT纯合子基因型减少肺结核空洞形成的风险性。等位基因IL-1B-511C和IL-1B-511T在非空洞肺结核和空洞肺结核组分布显著不同,携带T等位基因减少肺结核空洞形成的风险性。
2、IL-1B-31各基因型CC、CT、TT在对照组中出现的频率与在病例组中出现的频率比较,两组有显著性差异,携带TT纯合子基因型增加结核风险。等位基因IL-1B-31T和IL-1B-31C在对照组和病例组中分布有显著不同,等位基因IL-1B-31T增加结核风险。
3、IL-1RN仅发现三种基因型,各基因型1/1、1/2、2/2携带者在对照组中和病例组中出现的频率比较没有不同。等位基因IL-1R*1和IL-1RN*2在对照组和病例组中没有显著不同。
4、性别与多态性的关系的研究中发现,IL-1B-31、IL-IB-511、IL-1三个位点的基因型和等位基因频率分布在男性与在女性中比较,无论正常组还是对照组差别均无显著性意义。
5、对IL-1B-31和IL-1B-511进一步作连锁不平衡分析发现两位点之间几乎不存在连锁不平衡.说明IL-1各基因型对结核的危险性可能是独立的,可能不存在相互关联。
6、IL-1B-31、IL-1RN各基因型和等位基因频率在肺结核组、肺结核+肺外结核组、肺外结核组中的分布没有显著性差异,P>0.05。IL-1B-31、IL-1RN各基因型和等位基因频率在有空洞形成和无空洞形成肺结核组中的分布也没有显著性差异,P>0.05,说明其多态性分布对肺结核患者有无空洞形成没有影响。
7、 使用基因芯片与使用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法做出的结果一致。
结论:
1、遗传因素在结核病的发病中有一定的作用,IL-1B-31T、IL-1B-511T基因多态性的检测对结核风险的估计有价值。携带IL-1B-31TT纯合子基因型增加结核的风险性;等位基因IL-1B-31T增加结核风险。IL-1B-511等位基因T增加肺结核的易感性。IL-1B-511TT纯合子基因型减少空洞形成的风险性。等位基因IL-1B-511T减少肺结核空洞形成的风险性,其余各基因型和等位基因多态性与结核易感性、不同部位结核以及空洞形成无关。
2、IL-1RN有三种基因型,IL-1ra等位基因2和2/2基因型存在增加结核感染的可能性。
3、检测IL-1B-31和IL-1B-511以及IL-1RN基因多态性可用基因芯片的方法,与聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法比较,其有很多优点。基因芯片指对数以千记的DNA片段同时进行处理分析的技术,诸如基因组DNA突变谱和mRNA表达谱的检测等(Trends in Biotectlnology)。 该技术将大量探针分子固定于支持物上后与标记的样品分子进行杂交,通过检测每个探针分子的杂交信号强度进而获取样品分子的数量和序列信息。基因芯片技术的主要特点:技术操作简单、自动化程度高、序列数量大、检测效率高、应用范围广、成本相对低。在基因多态性的检测中使用基因芯片技术操作简单、节省时间、结果准确。