【摘 要】
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该研究对临床分离的耐氟喹诺酮类(FQs)药物的沙门氏菌基因突变的分子机制进行研究,并初步建立了氟喹诺酮类药物耐药性检测错配PCR方法.实验选择了动物源、人源的对氟喹诺酮类
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该研究对临床分离的耐氟喹诺酮类(FQs)药物的沙门氏菌基因突变的分子机制进行研究,并初步建立了氟喹诺酮类药物耐药性检测错配PCR方法.实验选择了动物源、人源的对氟喹诺酮类药物呈不同耐药程度的菌株和敏感菌株,分别提取各菌株的染色体DNA,并对gyrA基因和parC基因进行了聚合酶链式反应(PCR)和克隆测序.然后,应用计算机辅助软件WDNASIS对测序结果进行分析,以期确定国内动物源、人源耐药沙门氏菌gyrA基因和parC基因耐药突变特征,阐明沙门氏菌耐氟喹诺酮类药物的分子机制.最后根据突变位点附近的碱基序列来设计一系列灵敏度高的耐药检测引物,为快速进行耐药性的检测提供方法,为临床合理应用抗菌药提供理论基础.该课题研究内容分为3个部分.1.沙门氏菌临床耐药株及体外诱导耐药突变株的筛选.在临床广泛搜集沙门氏菌,并通过革兰氏染色法、沙门氏菌A-F多价血清玻板凝集试验及生化试验来进行鉴定.并对敏感菌株采用试管法在含亚抑菌浓度环丙沙星和恩诺沙星的药物压力下,与浓度递增相结合的方法进行耐药性诱导,筛选出8株耐药株.然后采用平板二倍稀释法测定沙门氏菌对环丙沙星、氧氟沙星、二氟沙星、恩诺沙星、诺氟沙星、洛美沙星六种药物的最小抑菌浓度(MIC),发现氟喹诺酮类药物之间确实存在交叉耐药现象.筛选出8株临床高度耐药株(MIC>16μg/mL,以下均为对环丙沙星的最小抑菌浓度),29株低度耐药株(MIC介于0.125μg/mL和16μg/mL之间),23株敏感株(MIC<0.125μg/mL).2.耐氟喹诺酮类沙门氏菌gyrA基因和parC基因突变研究.提取沙门氏菌的染色体DNA,根据沙门氏菌gyrA基因和parC基因氟喹喏酮类药物耐药决定区(QRDR)外侧核苷酸序列设计引物,合成了两对引物A1和A2以及C1、C2,进行PCR扩增,其片断长度分别是347bp和413bp,凝胶电泳鉴定,均获得特异条带.分别回收各特异条带,并与pMD18-T载体连接,转化至JM109感受态细胞中,采用蓝白菌落筛选法,成功的筛选了阳性克隆,提取重组质粒进行EcoRⅠ和HindⅢ双酶切和PCR鉴定后,进行测序.3.根据耐药基因的突变位点,设计引物,建立错配PCR(mismatch-PCR)方法,进行耐药性突变位点的快速检测.mismatch-PCR技术首先要根据测序后已知的突变设计合适的引物,其次是优化PCR循环条件,最后通过电泳观察即可判读结果.为此,分别设计了6套引物来检测gyrA基因和parC基因发生的各种类型的突变,检测结果表明,此方法对野生型和突变型的单个碱基的差异能够进行区分,检测突变位点的检出率在96%(54/56)以上,这是国内外首次采用mismatch-PCR技术成功进行沙门氏菌耐药性检测,为快速筛选耐FQs沙门氏菌提供了快捷的方法.mismatch-PCR具有简单可靠、适用性广、花费低廉等优点,在未来耐药基因突变快速检测领域中可能发挥更大的作用.
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