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生态功能区划是依据生态系统特征、受胁迫过程与效应、生态服务功能重要性及生态环境敏感性等分异规律而进行的地理空间分区，其目的是明确区域生态安全重要区和保护关键区，辨析存在的生态环境问题与脆弱区，为产业布局，生态保护与建设规划提供科学依据，它是实施区域生态环境分区管理的基础和前提。
近几年来，湖州市南浔区国民经济持续保持快速协调增长，综合实力进一步增强，但是在发展的过程中，存在一些深层次的问题：产业层次总体上不高，经济增长方式尚未根本转变，自主创新能力不强；人口和经济增长对生态系统的压力沉重，生态系统质量呈下降趋势，耕地利用强度大，耕地资源不足，农田生态功能衰退，农业生产对系统外投入依赖性强；生态环境恶化导致生物多样性下降，珍稀物种濒危和消亡趋势明显。因此，对南浔区进行合理的生态功能区划，促进社会与环境的协调发展，是南浔区今后一段时期的一项重要而紧迫的任务。
一、南浔区生态环境敏感性评价
根据南浔区生态系统特征，选用岩石类型、土壤类型、植被与土地利用、水分盈亏量等指标进行生态环境敏感性评价。评价结果显示：南浔区生态环境敏感性分为极敏感、高度敏感、中度敏感、轻度敏感和一般地区5个等级。其中：高度敏感区占全市总面积的0.35％，主要分布于千金镇西部与南部、善琏镇西南部；中度敏感区占0.60％，分布于菱湖镇南部、千金镇西部、南部与东部、善琏镇南部；轻度敏感区与一般地区分布最广，分别占全市面积的21.65％和77.40％。
二、南浔区区域生态服务功能重要性评价
根据南浔区自然环境、生态系统与社会经济发展特征，选择饮用水源保护、自然与文化遗产保护、生态系统产品提供等项目进行生态系统服务功能重要性评价。
评价结果显示，极重要地区分布相对较小，占全区总面积的1.99％，分散分布于各镇；重要地区占42.11％，集中分布于东部，主要南浔镇、练市镇、善琏镇大部分地区，和孚镇西北部也有分布；中等重要地区占了26.39％，相对集中分布于中部和西部的部分地区，主要包括双林镇大部分、南浔镇西部、旧馆镇西部，菱湖镇西部、善琏镇西北部；一般地区占29.51％，相对集中在西部和中部部分地区，主要包括旧馆镇东部、和孚镇东部与南部、千金镇大部、石淙镇大部、菱湖镇东部与南部。
本文通过对湖州市南浔区目前的生态环境现状、生态环境敏感性和服务功能等空间分异的研究，依据区划原则、方法和体系，形成了南浔区生态功能区划方案，将南浔区划分为35个生态环境功能小区，其中禁止准入区7个，限制准入区9个，重点准入区7个，优化准入区12个。以南浔区为例，旨为其他地区的生态功能区划、生态保护与建设提供科学借鉴。