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我国很多科研单位在上世纪末开始了从事业化管理向企业化管理的体制转变，转制过程中，项目的收入、支出、结转等核算方面的管理是转制的关键环节。但是由于科研单位主要承担各类研究和开发任务，虽然实行企业化管理，与典型的生产企业、建筑企业和交通企业仍然不尽相同;同时，与高等学校这类事业单位的科研项目管理也有所区别。因此，企业化的科研单位的项目财务管理是一类比较特殊的类型，由于没有现成的模式可以借鉴，在转制过程中存在着不少问题，本文分析了当前转制科研单位在财务核算管理方面存在的问题，主要包括:项目部对项目的核算管理缺乏足够的认识、项目部对项目的核算管理缺乏有效的控制、财务部在科目设置上不利于项目核算管理、项目核算不够明细化。 对企业财务管理、预算管理、成本控制、转制科研单位财务制度建设、项目核算制度等相关研究进行了综述。针对科研单位财务管理上预算约束力不够的问题，有学者建议采用项目成本核算的方式对经费进行管理，即以科研项目为成本费用的核算对象，对科研项目研发过程中发生的各种耗费进行归集、分配、全额计入成本对象的核算。在企业化的财务管理方面，一些学者认为全面预算管理是有效的管理控制工具，它不仅为企业实施战略管理提供了基础条件，还为出资人对企业实施有效的监督提供了基本依据，同时促进企业加强基础管理，提高企业的科学管理水平。对于责任成本管理，有学者认为通过责任预算的编制、责任成本分解、责任成本的控制，起到降低工程成本、增加经济效益的作用。另有学者阐述了强化成本管理与控制的一种内部管理制度。其主要准确划分成本的控内容包括:编制责任成本预算、核算与反馈、建立责任中心、编制范围、考核与分配等。借鉴了相关研究的进展和建设性的改进方案，进一步综合、提炼和整合，作为改进转制科研单位项目财务管理制度的参考素材。 在分析当前转制科研单位财务管理存在的问题的基础上，借鉴相关研究的进展和成果，应用全面预算管理理论、责任成本管理理论和项目核算理论，得到了对转制科研单位项目财务管理制度的改进措施。全面预算管理是利用预算对企业内部各部门、各单位的各种财务及非财务资源进行分配、考核、控制，以便有效地组织和协调企业的生产经营活动，完成既定的经营目标。是企业全过程，全方位及全员参与的预算管理。责任成本管理是西方责任会计和中国改革开放的实践相结合的产物，就是将直接发生成本和费用的各生产单位和业务部门，划分成若干个责任中心，然后根据各中心的责任范围，依据统一的编制办法编制各中心的责任预算，并采取合同的形式逐级进行承包的管理方法。项目核算管理的主体是项目，是由事业部经理组织项目管理人员按照项目管理需要和上级企业的要求，对项目发生的实际成本进行核算;核算的内容包括在项目实施中发生的人工成本、材料成本及为组织项目开发而发生的管理成本和相关费用;核算的目的是为成本控制提供数据和依据，为成本预测和计划提供信息。 转制科研单位项目财务管理改进措施由三部分组成，分别是:实行全面预算管理的财务预算管理制度、实行责任成本管理的财务收支管理制度和实行项目核算的财务核算制度。实行全面预算管理的财务预算管理制度的管理目标包括:实现对企业收入、成本费用和现金流的管理;实现对企业收入的提升和成本的节约;实现企业战略目标。管理原则包括:上下相结合的原则;现金收支两条线管理相结合的原则;落实管理制度与提高预算的约束力相结合的原则。管理方式是:以预算组织为组织保障，以预算目标的确定与分解为起点，依次通过预算编制、预算执行、预算考评等各环节完成年度的预算管理循环，在相应的管理阶段配以严格的预算制度，并辅以相关的预算指标体系、表格、规则以及预算管理权限，以保障体系的有效运行。实行责任成本管理的财务收支管理制度的管理目标是:实现对成本的量化管理;实现对项目实施过程的管理;实现全体人员参与的管理。管理原则是:总体性原则;可控性原则;及时性原则。管理方式遵循一定的管理步骤，主要程序有六个步骤，包括:划分责任单位、规定权责范围、确定责任目标、建立数据系统、考评工作绩效、编制责任成本报告。这六个内容按照先后次序循环往复进行。实行项目核算的财务核算制度的管理目标是:提高项目的效益;对项目收支进行监控;促使项目成为相对独立的财务单元。管理原则是:项目专款专用的原则;项目经费专人负责的原则;项目独立核算的原则。管理方式是:项目核算注重的是原始数据的收集、核算、统计汇总和加工处理，关键是核算的准确性;项目核算需要分工;项目核算对细心度的要求很高;要做到对核算项目分类的准确。 给出了一个依据笔者所在单位实际业务流程构造的项目财务管理案例，结合实例说明了改进转制科研单位项目财务管理的措施，即:实行全面预算管理的财务预算管理制度、实行责任成本管理的财务收支管理制度和实行项目核算的财务核算制度的应用方法。 本文通过分析当前转制科研单位在项目财务管理方面存在的问题，借鉴相关研究的进展和建设性的改进方案，通过综合、提炼和整合，并应用全面预算管理理论、责任成本管理理论和项目核算理论，得到了转制科研单位财务核算管理的系列措施，包括:实行全面预算管理的财务预算管理制度、实行责任成本管理的财务收支管理制度和实行项目核算的财务核算制度，并结合实例说明了这些财务核算管理制度的应用方法，为改进当前转制科研单位的项目财务管理提供了理论和方法上的参考。