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随着测序等生物技术的进步和发展，越来越多的非编码RNA被发现，并且其功能也逐渐被鉴定出来，目前非编码RNA已经成为一个重要的研究领域，作者以线虫作为模式生物，对短的(50～500碱基)非编码RNA进行了系统的研究。
作者实验室建立和发展了一套分离小RNA的技术，利用该技术在线虫中发现了100个新的非编码RNA，通过序列分析作者发现了两个新的基因家族和3个非编码RNA特有的上游保守序列.结合小RNA分离技术和全基因组嵌合(tiling)芯片技术，作者构建了线虫的全基因组转录图谱，发现线虫70％的基因组都有转录，且大部分为非编码RNA，我们通过分析，鉴定出了1200个短的非编码RNA。
为了研究这些非编码RNA的表达，作者构建了同时检测非编码RNA和编码RNA的联合芯片，通过表达谱分析，作者发现20％的非编码RNA在不同发育时期和不同条件下有不同的表达模式，并且内含子中的非编码RNA同其宿主基因的表达关系同非编码RNA有无保守上游调控序列有很强的相关性，
为了研究非编码RNA的功能，作者建立了线虫的RNAi系统，作者通过实验证明RNAi虽然对编码RNA很有效，但是对几乎所有已知类别的非编码RNA都无效。但是作者发现沉默与非编码RNA相结合的蛋白可以有效的沉默相关非编码RNA，结合芯片技术，作者系统的检测了与snoRNA相结合的蛋白被沉默后，非编码RNA表达的变化，并以此建立了一种从实验水平检测非编码RNA和蛋白相互作用的方法，这种方法将可以用来揭示非编码RNA的系统分类和功能。