基于深度学习的心脏超声形态分析

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当今社会人们的工作压力大,再加上饮食不规律、缺乏运动等不良生活方式,使得心血管疾病频发。心脏超声作为医生诊断心脏疾病的重要手段,能够直观的显示病人的心脏解剖结构和症状。基于此研究背景,如何利用计算机快速准确的处理心脏超声成为一大研究热点。近年来,深度学习算法的突破与发展极大的推动了各研究领域的变革,如汽车无人驾驶、情感识别和人脸识别等。将深度学习算法应用到心脏超声影像中能够辅助医生进行诊断、给出治疗方案、计算医学参数等,有效的减少了医生的工作量,对计算机辅助诊断系统有重要的意义。据我们所知,将深度学习应用到超声心动图上的研究较少,且目前还没有科研工作将RetinaNet用于左心室定位或将LedNet等分割网络用于左心房分割。基于此背景,本文基于深度学习算法对心脏超声的形态进行分析,以辅助医生更好的诊断心脏疾病与给出后续的治疗方案。
  本文在实验过程中主要遇到两个挑战:一是公开的带有完整标签的数据集很少,并且数据量很少;二是心脏超声影像大多数为灰度图像,灰度、纹理等特征较少,使用传统的方法得不到有效的分析。为了解决以上的问题,本文主要做了四个方面的贡献:
  (1)创建了三个数据集。由于医学图像中含有大量病人信息,隐私性较强,因此,公开的带有完整标签的数据集较少。因此,本文针对研究任务的不同分别创建了相应的数据集。一是创建了心脏超声视图分类数据集,该数据集包含六个视图4837张图像;二是左心室定位数据集,包含完整左心室的心尖二腔室(apical two-chamber, A2C)、心尖三腔室(apical three-chamber, A3C)、心尖四腔室(apical four-chamber, A4C)三个视图3653张图像;三是左心房内外膜分割数据集,包含A2C、A3C、A4C三个视图1480张图像。数据集中所有图像均来自医院实地采集,对临床治疗更具意义。
  (2)基于深度学习的心脏超声视图分类。在心脏超声视图分类数据集上,分别使用AlexNet、ResNet、VGG、DenseNet四种分类网络对六种心脏超声视图进行训练,之后对分类性能进行比较评估。实验结果表明,DenseNet取得了最好的效果,正确率可达99.90%。
  (3)基于深度学习的左心室定位。基于创建的左心室定位数据集,通过RetinaNet进行左心室定位任务并得到最终的左心室定位结果图。用mIoU作为左心室定位效果的评价指标分别对A2C、A3C、A4C视图进行测试,其结果分别为85.83%、79.42%、83.87%。
  (4)基于深度学习的左心房内外膜分割。基于创建的左心房内外膜数据集,利用FCN、DeepLab、LedNet、PSPNet、DANet、CGNet、DenseASPP、ENet、ESPNet这9种分割网络对左心房内外膜进行分割,针对不同的心脏视图,充分比较不同分割网络的效果和实验时间。从评价指标看,对于Hausdorff距离,A3C中ENet效果最好,结果为3.8939;对于ASD,A4C中ENet效果最好,结果为0.5491;对于Dice系数,A3C中LedNet效果最好,结果为0.8339;对于PixelAccuracy,A3C中LedNet效果最好,结果为0.9934。
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