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“十二五”时期，新疆经济社会发展呈现出新的阶段性特征。党中央、国务院根据新疆在国家战略全局、核心利益中的特殊重要性，高瞻远瞩，统揽全局，做出了推进新疆跨越式发展和长治久安的总体战略部署，突出强调了新疆发展和稳定的特殊重要地位、特殊重要意义和新疆肩负的特殊重要任务。新疆是我国实施西部大开发战略的重点地区，是祖国西北的战略屏障，是对外开放的重要门户，是国家战略资源的重要基地;新疆的发展和稳定关系全国改革发展稳定大局，关系祖国统一、民族团结、国家安全，关系中华民族的伟大复兴。新疆生产建设兵团作为推动新疆改革发展、促进社会进步的建设大军，增进新疆民族团结、确保社会稳定的中流砥柱，巩固西北边防、维护祖国统一的铜墙铁壁，在推进新时期新疆跨越式发展和长治久安的总体战略中作用十分重大。 本文通过对新疆屯垦历史的回顾，特别是对新疆生产建设兵团的历史沿革的总结，在新疆面临的新时期跨越式发展和长治久安的战略格局中，分析新疆地方与兵团在发展融合经济方面的实践成果，在全面总结当前存在问题的基础上，指出新疆地方与兵团发展融合经济，必须建立区域统筹发展协调机制，按照产业、城市体系及流域统一规划、管理，避免因行政归属所带来的利益分配和各类纷争问题、重复建设与相互制约的矛盾。按照“边疆同守、资源共享、优势互补、共同发展”的原则，通过资本市场收购和兼并企业，以多元化产权的股份制企业形式参与新疆优势资源开发、重大项目建设、出口基地建设、中转集散地和国际商贸中心建设，使地方与兵团的优势资本和人才融入新疆的跨越式发展中去。 同时结合对乌鲁木齐经济技术开发区与十二师共建兵地合作区案例的深入分析，集中阐述了建设地方与兵团综合配套改革实验区的基本思路。提出以合作区为突破口和关键布局，打破行政管理体制制约，加快推进合作范围与深度，重点探索区域融合城乡统筹发展、区域可持续发展、增强自主创新、扩大对外开放、统筹区域产业发展、优化区域经济结构、区域公共服务、区域土地资源管理、法制型效能型行政管理体系建设的体制机制。在此基础上，统筹好各方面关系，大力建设资源节约型、环境友好型社会;统筹城乡发展和人与自然的和谐发展，宜工则工、宜商则商、宜居则居;进一步发展壮大兵团，促进地方与兵团融合，充分发挥其在促进发展、维护稳定中的作用;建立以工促农，以城市带团场、带乡村的新机制，全面提高这一特殊区域的综合承载能力，缩小与内地在经济社会发展水平，特别是公共服务水平的差距，使城乡面貌得到极大改观，各族群众生活水平得到极大改善。