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本研究采用PCR-RFLP技术分别对国内外杜洛克猪、约克夏猪、皮特兰、长白猪、五指山猪、梅山猪、枫泾猪、二花脸猪、苏太猪、临高猪、乐平花猪、万安花猪、藏猪、荣昌猪和亚洲野猪等15个猪品种的α1-岩藻糖转移酶(FUT1)基因和Mx1基因进行了多态性检测,计算了其基因频率和基因型频率,并基于Nei氏遗传距离构建NJ系统发生树。同时依据苏太猪的繁殖性能记录,利用SPSS11.5软件统计分析了两个基因的不同基因型对繁殖性状的效应,具体结果如下:(1) FUT1基因M307位点PCR产物长度为161bp,采用限制性内切酶Hin6Ⅰ消化后共出现3种基因型,分别为AA、AG和GG基因型;FUT1基因M857位点PCR产物长度为174bp,采用限制性内切酶AciⅠ消化后仅出现2种基因型,分别为AG基因型和GG基因型。对FUT1基因两个突变位点进行重新设计引物、PCR扩增和克隆测序发现,FUT1基因开放阅读框307bp处确实存在G/A突变,突变的结果导致相应的氨基酸由苏氨酸代替了丙氨酸;而在857bp处为C/T突变,突变的结果导致相应的氨基酸由精氨酸变为色氨酸。(2)FUT1基因M307位点只有在引进猪品种杜洛克、皮特兰中检测到AA型纯合子,在引进猪品种中的约克夏、长白猪以及所有的国内地方猪品种、亚洲野猪以及培育猪品种中均未发现AA型纯合子,且亚洲野猪和国内地方猪品种大部分个体为GG型纯合子;国内地方猪品种在M857位点,除临高猪有少量AG基因型个体外,其他猪品种均仅存在GG基因型。(3)Mx1基因PCR扩增产物长度为290bp,采用限制性内切酶Hin6Ⅰ消化后在不同猪品种中存在6种基因型,分别为AA、BB、CC、AB、AC和BC。对3种纯合基因型进行克隆测序发现,AA型个体的序列与Genbank序列完全一致,为野生型,BB型个体在第2065 bp处出现G/T突变,第2098 bp处出现A/G突变,第2105 bp处出现A/G突变,第2124bp处出现G/A突变;CC型存在包含有酶切位点的11个碱基缺失,同时第2098 bp处出现A/G突变。(4)Mx1基因在4个引进猪品种中仅出现A和C两种等位基因,AA、CC和AC 3种基因型;而在国内地方猪品种以及亚洲野猪中仅出现A和B两种等位基因,AA、BB和AB 3种基因型;培育猪品种苏太猪中存在全部基因型。(5)根据各猪品种FUT1基因和Mx1基因等位基因频率,基于Nei氏遗传距离构建NJ系统发生树发现,国内外猪品种FUT1基因和Mx1基因的遗传背景存在差异,国内地方猪品种和亚洲野猪间血缘较近,引进猪品种与含有引进猪品种血缘的培育猪品种间遗传距离相对较近。(6)将苏太猪FUT1基因多态性与繁殖性能进行关联分析,结果表明,苏太猪FUT1基因M307位点AG基因型的所测繁殖性能均高于GG基因型的个体。在初产中,AG基因型与GG基因型的断奶仔猪数差异显著(P<0.05);在经产胎次中,AG基因型与GG基因型的总产仔数差异显著(P<0.05)。(7)将苏太猪Mx1基因多态性与繁殖性能进行关联分析,结果表明,在经产胎次中,苏太猪Mx1基因各基因型间所测繁殖性能均存在差异,在总产仔数、初生窝重、断奶仔猪数和断奶窝重上,基因型BC与基因型AA、AB、AC和CC间均存在显著差异(P<0.05);在产活仔数上,基因型BC与基因型AA、AC和CC间均存在显著差异(P<0.05),BC基因型在各性状上均表现为最高。