乳腺癌相关通路与小分子网络重构

来源 :哈尔滨医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shoolove
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寻找能够针对性治疗某种疾病的药物是药物研发的主要目的。而目前的药物研究大都是从特定的靶蛋白结构入手,利用组合化学的手段找到能与该靶点互相作用的候选分子。这种方法受到疾病和药物结构等先验知识的限制。在研究乳腺癌这种复杂疾病时,传统的药物研究方法更加备受局限。随着多种高通量的基因组技术的发展,药物基因组学应运而生。基因芯片技术能够同时检测成千上万的基因的表达信息,也被大量应用到药物研究的领域之中,从整体表达模式上显示小分子的作用。本研究即利用了乳腺癌的基因表达谱数据,找出与乳腺癌相关的通路与候选小分子之间的关系,重建其关联网络。   首先,通过分析表达谱数据找出与乳腺癌相关的差异表达基因,将之富集到KEGG通路中,找到与乳腺癌相关的通路,建立疾病与通路之问的联系。之后,以找到的这些乳腺癌相关的通路为单位,搜索Corulectivity MAP数据库,找到与每个通路中的差异表达基因的表达相似或相反的小分子。最后,根据这些通路一小分子的关系,重建关联网络。   比较两套不同来源的乳腺癌数据得到的通路-小分子网络,找到15个共有的通路。这些通路是与乳腺癌密切相关的,可以帮助我们从生物学过程的角度理解乳腺癌的致病机理,以及其在人体中产生的总体变化。同时,发现了29个共有的通路一小分子关系对。这些关系对中的小分子能够影响乳腺癌的相关通路,因此可以作为治疗疾病的候选药物,为针对乳腺癌的药物研究提供有价值的参考。   本研究利用生物信息学方法,比较乳腺癌相关通路与多种小分子的基因表达模式,将乳腺癌、通路、小分子有机的联系起来,为乳腺癌相关的疾病、药物研究提供一种崭新的视角。
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