磷酸二酯酶4与抑制剂作用的模拟分析及其重组表达

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目的:通过分子动力学模拟,考察PDE4B2和配体抑制剂的相互作用特征,探索新抑制剂设计方案。方法:Rolipram和PDE4B来自1R06.pdb。用InsightⅡ2005 LS转换文件并确认。用ICM-pro将配体与PDE4B2活性中心对接。用PRODRG2生成抑制剂参数文件。用GROMACS 96力场,Berendsen温度与压力控制模型,SPC216水,加钠离子到中性后进行1ns分子动力学模拟。用配体结合腔穴体积及原子间距离分析PDE4与配体作用。结果:模
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