【摘 要】
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喜马拉雅旱獭(Marmota himalayana)主要分布在青藏高原地区,是我国鼠疫杆菌的主要宿主之一。我们从青海省玉树地区采集的喜马拉雅早獭肠内容物样本中,低氧培养分离获得1株变
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喜马拉雅旱獭(Marmota himalayana)主要分布在青藏高原地区,是我国鼠疫杆菌的主要宿主之一。我们从青海省玉树地区采集的喜马拉雅早獭肠内容物样本中,低氧培养分离获得1株变形梭杆菌(Fusobacterium varium)WYT-7、3株鹑鸡肠球菌(Enterococcus gallinarum)HT1、HT20-15及HT34-7菌株,并完成变形梭杆菌WYT-7菌株的全基因组测序和基本基因组分析。基因组数据分析表明,WYT-7菌株携带多个与毒力基因同源的基因,包括梭杆菌属粘附相关蛋白FadA(Fusobacterium adhesin A)等。核心基因(core gene)进化分析表明,WYT-7 菌株在进化中与F.variumATCC27725亲缘关系最近,并与溃疡梭杆菌(Fulcerans)位于同一分群。此外,预测分析表明WYT-7菌株携带16个基因组岛,15个位于染色体,1个位于质粒。从喜马拉雅旱獭分离的3株鹑鸡肠球菌,肠球菌常见毒力基因检测均为阴性,包括聚合物因子基因(asal)、肠球菌表面蛋白基因(esp)、透明质酸酶基因(hyl)、明胶酶基因(gelE)及细胞溶血素基因(cylA);对15种检测的抗菌药物均不耐药,包括青霉素G、氨苄西林、万古霉素、四环素、红霉素等。鉴于鹑鸡肠球菌可引起院内感染,包括败血症、化脓性感染等,我们的研究提示,动物源性的鹑鸡肠球菌可能在进化过程中获得了抗菌药物耐药性基因以及毒力基因等,从而产生了对人致病的能力。
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