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[目的]： 探讨p40、p63、CK5/6和TTF-1在肺腺癌和肺鳞癌中的表达及意义，及各指标与患者的年龄、性别、吸烟史、病理类型、分化程度、肿块大小、淋巴结转移及TNM分期之间的关系;寻找对肺腺癌和肺鳞癌鉴别诊断有意义的标记物。 [方法]： 收集2011年1月至2012年12月温州医科大学附属第一医院外科手术切除的肺腺癌病理标本108例、肺鳞癌病理标本66例，制作成组织芯片，采用免疫组织化学法检测p40、p63、CK5/6和TTF-1在其中的表达情况。同时收集各肺癌患者的临床病理指标（年龄、性别、吸烟史、病理类型、分化程度、肿块大小、淋巴结转移及TNM分期），应用SPSS17.0软件分析各组间蛋白表达的差异性及各免疫组化指标与患者临床病理特征之间的相关性。 [结果]： (1) p40、p63、CK5/6、TTF-1蛋白在肺鳞癌中的表达 p40在肺鳞癌中的阳性表达率为93.9％(62/66)，阳性者62例，其中12例(+)、27例(++)、23例(+++);p63在肺鳞癌中的阳性表达率为86.4％(57/66)，阳性者57例，其中14例(+)、25例(++)、18例(+++);CK5/6在肺鳞癌中的阳性表达率为89.4％(59/66)，阳性者59例，其中17例(+)、21例(++)、21例(+++);TTF-1的阳性率为6.1％(4/62)，阳性者4例，其中2例(+)、1例(++)、1例(+++)。 (2)p40、p63、CK5/6、TTF-1蛋白在肺腺癌中的表达 p40在肺腺癌中的阳性表达率为3.7(4/108)，阳性者4例，4例(+);p63在肺腺癌中的阳性表达率为22.2％(24/108)，阳性者24例，其中20例(+)、4例（++）;CK5/6在肺腺癌中的阳性表达率为24.1％(26/108)，阳性者26例，其中18例(+)、8例(++);TTF-1在肺腺癌中的阳性表达率为95.4％(103/108)，阳性者103例，其中22例(+)、40例(++)、41例(+++)。 (3) p40与p63、CK5/6在肺鳞癌中表达的比较 p40、p63、CK5/6在诊断肺鳞癌中的特异性分别是96.3％、77.8％、75.9％，经统计差异有统计学意义（X2=17.472，P＜0.05），p40特异性高于p63（P＜0.05）、CK5/6，p63与CK5/6对肺鳞癌的特异性没有明显差别(P＞0.05);三者对肺鳞癌的灵敏度分别是93.9％、86.4％、89.4％，差异无统计学意义（X2=3.526，P=0.172）。 (4) p40、p63、CK5/6在不同分化程度肺鳞癌中的表达 在低分化肺鳞癌中p40的阳性表达率(89.3％)与p63(78.6％)、CK5/6(82.1％)的阳性表达率差异有统计学意义（X2=6.758，P＜0.05），p40阳性表达率高于p63（P＜0.05)、CK5/6（P＜0.05)，p63、CK5/6在低分化肺鳞癌中的阳性表达率没有明显差异(P＞0.05);p40(97.2％)、p63(91.7％)、CK5/6(97.2％)在中分化肺鳞癌中的阳性表达率差异无统计学意义（X2=1.678，P＞0.05）。 (5) p40、p63、CK5/6、TTF-1与临床病理指标之间的相关性 p40、p63、TTF-1的表达与性别、病理类型、肿块大小、吸烟史有关（P＜0.05），与年龄、分化程度、淋巴结转移及TNM分期无关（P＞0.05）;CK5/6的表达与性别、病理类型、肿块大小、吸烟史及分化程度有关（P＜0.05），与年龄、淋巴结转移及TNM分期无关(P＞0.05)。 [结论]： (1)在肺鳞癌和肺腺癌的鉴别诊断中p40特异性高于p63、CK5/6，p40较p63、CK5/6在低分化肺鳞癌中的阳性表达率较高，故在鉴别肺鳞癌和肺腺癌尤其是低分化肺鳞癌和肺腺癌时P40是一个更优的指标。 (2) p40、p63、TTF-1与性别、病理类型、肿块大小、吸烟史有关，与年龄、分化程度、淋巴结转移及TNM分期无关;CK5/6与性别、病理类型、肿块大小、吸烟史及分化程度有关，与年龄、淋巴结转移及TNM分期无关。