四大家鱼原种场鲢亲本与子代线粒体DNA D-loop区段遗传多样性分析

来源 :中南民族大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:naizhi1006
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鲢(Hypophthalmichthys molitrix)作为我国著名的“四大家鱼”之一,在我国水产养殖历史悠久,是我国淡水经济养殖鱼类中重要的品种,广泛分布于我国各大水系。近年来,由于大规模的水利水电工程的修建、生态环境的破坏、长期的过度捕捞、近亲繁殖和不科学的增殖放流,导致我国野生鲢渔业资源和种质资源严重下降。因此,对提供人工养殖和增殖放流的原种场鲢亲本与苗种的遗传多样性研究显得十分重要。本研究以线粒体DNA D-loop区域为分子标记,分析国家级四大家鱼原种场鲢亲本与子代的遗传多样性和遗传结构,以期为我国四大家鱼原种场建设提供依据。利用PCR技术对采自长沙、监利、嘉兴、瑞昌、石首、陕西、吴江和扬州四大家鱼原种场八个鲢亲本群体与七个鲢子代群体的mtDNA D-loop区域进行扩增、测序并分析,主要研究结果如下:(1)鲢亲本群体的遗传多样性和遗传结构分析①八个鲢亲本群体共303个个体,定义了71个单倍型,平均单倍型多样性Hd为0.933±0.010,核苷酸多样性Pi为0.016±0.001,表明原种场鲢亲本遗传多样性较高。②鲢亲本群体总的遗传分化指数Fst为0.02181且P值不显著,表明鲢亲本群体间没有明显的遗传分化;由AMOVA分析结果可知,鲢亲本群体内遗传变异占了97.82%,而仅有2.18%的遗传变异来自群体间,进一步说明鲢亲本群体的遗传变异主要来自群体内,群体间不存在明显的遗传分化。③八个鲢亲本群体的中性检验和核苷酸不配对分布结果均表明八个群体近期没有发生过种群的扩张事件,种群相对稳定,进化历史悠久。(2)鲢子代群体的遗传多样性和遗传结构分析①七个鲢子代群体267条D-loop序列,检测到了37个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.843±0.021、0.01506±0.00177,表明原种场鲢子代遗传多样性仍处于较高水平。②鲢子代群体总的遗传分化指数Fst为0.08037且P值达到显著性标准,表明鲢子代七个群体间存在着一定程度的遗传分化;AMOVA结果显示,群体内遗传变异占了91.96%,而群体间的变异贡献率仅占8.04%,与鲢亲本遗传变异情况相比鲢子代群体间变异贡献率有所增加,但主要的遗传变异还是来自群体内,群体间遗传分化程度偏低。③七个鲢子代群体的中性检验和核苷酸不配对分布结果均表明七个鲢子代群体近期也没有经历种群的扩张事件,种群相对稳定。综上分析可知,目前国家级四大家鱼原种场鲢亲本与子代的遗传多样性较为丰富,能为我国水产养殖业和增殖放流提供优良种质资源的亲本与苗种。
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