【摘 要】
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杀鱼爱德华氏菌(Edwardsiella piscicida)会引起严重的鱼类爱德华氏菌病,给世界水产养殖带来严重损害。本课题利用转座子插入测序(TIS)技术,探究了E.piscici a在冬季(16℃)和夏季(28℃)的海水中存活的决定性遗传因子。TIS数据表明,E.piscicida基因组上编码的71个基因在16℃海水中显示其必需性,包括代谢系统,转运系统和Ⅲ型分泌系统(T3SS);63个基因
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杀鱼爱德华氏菌(Edwardsiella piscicida)会引起严重的鱼类爱德华氏菌病,给世界水产养殖带来严重损害。本课题利用转座子插入测序(TIS)技术,探究了E.piscici a在冬季(16℃)和夏季(28℃)的海水中存活的决定性遗传因子。TIS数据表明,E.piscicida基因组上编码的71个基因在16℃海水中显示其必需性,包括代谢系统,转运系统和Ⅲ型分泌系统(T3SS);63个基因在28℃海水中显示其必需性,包括转录、翻译、能量代谢和能量转化相关的基因。其中,脂肪酸代谢调控因子编码基因fadR同时在16℃和28℃条件下显示其必需性,而fabR插入突变后在16℃和28℃条件下存活能力增强,说明脂肪酸代谢和E.piscicid 在自然海水条件下存活密切相关。基于上述TIS筛选结果,本课题进一步利用ChIP-seq、RNA-seq和质谱等技术,探究脂肪酸代谢核心调控因子FabR调控不同脂肪酸组成和比例的分子机制,以及脂肪酸代谢和E.piscicida毒力表达之间的关系。FabR通过直接结合fabA、fabB和cfa讲启动子区域,抑制fabA、fabB和cfa的表达,进而调控脂肪酸组成。此外,RNA-seq数据显示,FabR激活E.piscicida氧化磷酸化、T3SS和Ⅵ型分泌系统(T6SS)表达。总之,本课题发现FabR全局调控脂肪酸代谢、T3/T6SS毒力基因表达,对E.piscicida在海水中的存活以及鱼体内的毒力表达过程起到重要作用。
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