【摘 要】
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通过免培养的分子生物学方法,对竹鼠盲肠的微生物多态性进行初步的探索性研究,从而为竹鼠肠道微生物的多态性和微生物的分离纯化以及功能性基因的克隆提供相关的理论依据。采
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通过免培养的分子生物学方法,对竹鼠盲肠的微生物多态性进行初步的探索性研究,从而为竹鼠肠道微生物的多态性和微生物的分离纯化以及功能性基因的克隆提供相关的理论依据。采用改良的反复冻融法提取竹鼠盲肠微生物的总DNA,用细菌通用引物F27/R1492扩增出细菌16S rRNA的全部序列,构建16SrRNA基因文库。用Hae Ⅲ和Hha Ⅰ两种限制性内切酶对阳性克隆子的扩增产物进行酶切,挑选不同的OTU(操作分类单位)测序,通过BLAST在线比对,选择相似度较高的若干个序列构建系统发育树,比较代表克隆子基本分类种群和生物多样性的构成。结果表明,改良的反复冻融法所提取的总DNA条带整齐、明亮；改进的重组子鉴定方法能够快速准确的筛选出阳性重组子；酶切分型之后,发现竹鼠盲肠中存在34个OTU,说明竹鼠盲肠中有着丰富的微生物菌落分布,其中大部分是未培养或未知的菌株,在分类学上具有潜在意义的被选菌株,同时也有乳酸菌属、芽孢杆菌属、梭形杆菌属和多粘类芽孢杆菌的分布。
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