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本实验在我国浙江省宁波市咸淡水南美白对虾生态综合养殖场进行。该地区的对虾养殖技术较成熟，形成了规模化、规范化、集中化的经营管理模式。且养殖模式多样，以综合养殖为主，生态健康的养殖方式已经成为该地区今后的主导方向。本实验在全面分析南美白对虾池塘底质波动状况的基础上，结合平板菌落计数法和16S rDNA序列分析等方法，监测了底泥中细菌数量的周期性动态变化，并进一步对底泥细菌种类进行鉴定，分析其群落结构组成。模拟底泥环境细菌种群构成，采用MPN试管法对相关生理类群细菌特征进行分析，探讨细菌细菌在底泥生态系统生源要素循环中的作用，以及优势生理类群对底质环境的指示作用，为开发有益菌和南美白对虾的健康养殖提供理论指导。主要研究结果如下：1.于2011年5月至10月，在浙江省宁波市选择了6个南美白对虾综合养殖池塘，采集底泥测定有机质含量、总氮、总磷等理化性质，并进一步采用对硝基苯磷酸二钠(p-NPP)法和荧光素双醋酸酯法，检测碱性磷酸酶活性(APA)、微生物活性(FDA)等指标，在此基础上分析和探讨环境因子和微生物酶活性的关系，结果表明：APA和FDA、总氮和APA均有极显著的正相关性(ɑ=0.01)；总磷和FDA表现出显著的正相关性(ɑ=0.05)；底泥有机质含量、总磷和总氮三者之间未呈现显著相关性。从结果来看，养殖系统中底泥的理化性质和微生物酶活性间有极大的关联，然而纯粹的环境因子分析，在本实验中没有表现出很大的研究价值。可见，说明通过结合微生物因子才能获得比较可靠、合理的推测和结果。另外，APA和FDA有显著相关性，APA在一定程度上可以较准确的指示底泥细菌的状况，作为养殖系统底质有机污染的综合检测指标。2.于2012年5月至9月，在浙江省宁波市南美白对虾综合养殖场进行实验。采用平板菌落培养计数和16S rDNA序列分析等方法，对底泥细菌、环境因子在整个养殖周期的动态变化进行研究，并在此基础上进一步对底泥细菌进行分离、纯化和鉴定，分析其群落结构组成，探究底泥生态系统细菌多样性。结果显示：(1)底泥中异养菌数量在8月初达到峰值，波动范围为(45±2.3)×105—(110±5.9)×105cfu/g之间，芽孢杆菌数量变动范围为(50±11.2)×104—(106±5.8)×104cfu/g之间，弧菌总数波动幅度为0—(23±2.7)×103cfu/g之间，峰值均出现在7月份。(2)底泥中有机质与总磷有极显著的负相关性(ɑ=0.01)，但有机质与异养菌数则呈显著正相关性，总磷和异养菌数也呈现显著负相关；芽孢杆菌数量与弧菌数量之间表现出了显著的正相关性。(3)在单养模式中，底泥细菌优势属依次为芽孢杆菌属、弧菌属和葡萄球菌属；混养模式则为芽孢杆菌属、弧菌属和假单胞菌属。芽孢杆菌属在单养和混养模式中的均占据主导地位，其所占比例分别为46.6%和51.5%。对底泥中的异养菌组成进行Shannon—Wiener多样性指数比较，结果表明混养池塘底泥异养菌多样性指数较高。3.通过对相关生理类群细菌及优势生理类群和种群的研究，探讨细菌在底泥生态系统C、N和P循环中的作用。结果表明，在碳素方面：底泥环境中代谢淀粉和明胶蛋白的细菌数量较多，同时种群结构也比较丰富。氮素方面：在种群丰度上硝酸盐还原菌极多，其次是硝化和氨化细菌，反硝化细菌不多，亚硝酸还原菌极少；在数量上则是氨化细菌最多，其次才是硝酸盐还原菌。磷素方面：细菌中具磷酸酯酶、分解卵磷脂的能力明显强于转化Ca3(PO4)2的能力，从总体上看，其细菌类群数量和种群丰度低，底泥中细菌对磷的代谢能力普遍不强。