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中国-东盟自由贸易区的股票市场具有独特而鲜明的特征:市场开放程度不高、证券化率低且内部差异性大。经济的一体化和金融危机都会影响股票市场间的相关性。已有研究将两者分开考虑，本文提出在中国-东盟自由贸易区经济一体化的进程中，国际金融危机对中国和东盟股票市场相关性的影响是个值得探讨的问题。且现有的亚洲股票市场间相关性研究集中于讨论线性相关和非线性相关。本文应用 C-MGARCH模型将线性相关和非线性相关结合起来考虑，引入混合遗传算法得到全局最优解，构建新的模型——基于混合遗传算法的C-MGARCH模型。 然后本文选取富时东盟指数和上证180指数全收益数据分别代表东盟和中国股票市场的基本面，以2008年9月15日全球金融危机爆发为界将数据分成金融危机前和后金融危机时期分别考察。 最后运用 R软件编程，实证结果说明以下三点:一，就模型选择来说，copula函数的选择比MGARCH模型的选择对实证结果的影响更大;二，就相关性来说，中国和东盟的股票市场不论是在金融危机前还是在后金融危机时期都存在一定的相关性，国际金融危机加强了该相关性;三，就尾部相关性来说，金融危机前中国和东盟股票市场的尾部分布渐进独立，后金融危机时期下尾相关性更强。