莴苣褪绿病毒基因组序列分析与CPm蛋白多克隆抗体应用

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莴苣褪绿病毒(Lettuce chlorosis virus,LCV),是近年来我国新发侵染茄科作物病毒。该病毒与我国爆发性严重危害茄科作物病毒-番茄褪绿病毒(Tomato chlorosis virus,ToCV)类似,都属毛形病毒属(Crinivirus),基因组、传播扩散方式等特性类似。鉴于ToCV对我国茄科重要经济作物的严重威胁,LCV也可能具有爆发严重威胁我国茄科作物的潜力和趋势。因此,急需加强该病毒致病性,快速检测技术等研究,明确该病毒分布与致病性等特性,明确其对我国茄科作物的潜在威胁。采用RT-PCR技术结合常规Sanger测序,测定了LCV山东寿光分离物(LCV-SD)的近全长全基因组序列,在NCBI上对序列在线分析,用DNAMAN将其与同属病毒进行多序列比对,利用MEGA 5.0构建系统发育树。结果表明,LCV-SD基因组RNA1链序列,与我国重庆分离物同源性最高,达到98.39%,与美国等其他国家分离物同源性均较低,为84.27%~85.07%;RNA2链序列,也与我国重庆分离物同源性最高,达到99.05%,与其他国家分离物同源性也较低,为87.68%-88.36%。系统发育分析表明,LCV-SD与我国其他地区(南京、重庆)分离物聚为一簇。LCV CPm蛋白是LCV的结构蛋白,位于LCV病毒粒子表面,因此选择LCV CPm蛋白为目标,原核表达LCV CPm基因,亲和层析纯化CPm蛋白,作为抗原免疫新西兰大白兔,制备多克隆抗体。多克隆抗体的浓度为1.44 mg/mL,间接ELISA检测其效价最大值为1:64000;Western blotting检测,LCV CPm多克隆抗体最佳稀释倍数为10 000倍,特异性高。研究结果表明,该多克隆抗体可应用于LCV的Western blotting和Dot-ELISA检测。
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