靶向抑制DNA-PK克服非小细胞肺癌三代EGFR-TKI奥希替尼获得性耐药的机制探索

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目的:研究非小细胞肺癌(NSCLC)奥希替尼获得性耐药细胞中,靶向DNA-PK联合Osimertinib克服奥希替尼耐药的效果及分子机制,为临床晚期NSCLC奥希替尼耐药后的治疗提供新的帮助。方法:本课题分成三个部分展开研究:1、选取具有EGFR L858R/T790M双突变的非小细胞肺癌H1975细胞系,Osimertinib从低浓度到高浓度持续诱导构建耐药细胞模型;二代测序检测亲本及耐药细胞株基因组变化差异,验证目前已知耐药机制及寻找耐药驱动基因。2、无明确耐药驱动基因的情况下,试图确定与Osimertinib具协同作用的化合物所揭示的靶点或通路。从文献提供的化合物库中,筛选到化合物PI103与Osimertinib具有协同作用。随后CCK8实验及Calcusyn软件检测PI103各靶点(m TOR、PI3K及DNA-PK)抑制剂与Osimertinib的联合作用效应,测得DNA-PK特异性抑制剂NU7441与Osimertinib联合作用能协同抑制耐药细胞增殖;结晶紫染色进一步检测联合用药对耐药细胞存活能力的影响;流式细胞周期检测联合作用对耐药细胞周期分布的影响;最后慢病毒质粒降表达DNA-PK,CCK8检测耐药细胞中DNA-PK降表达对Osimertinib敏感性的影响;3、DNA-PK是参与DNA损伤修复反应的关键激酶之一,且EGFR在DNA损伤修复中起着重要作用,随后检测Osimertinib长期诱导后,耐药细胞EGFR活性的抑制是否对DNA损伤修复造成影响,以及靶向DNA-PK是否有助于克服Osimertinib耐药。利用Cisplatin诱导DNA损伤,γH2AX水平评估DNA损伤程度,彗星实验评估DNA损伤及修复情况;首先Western Blot检测相同Cisplatin诱导下敏感及耐药细胞细胞γH2AX的水平差异;碱性彗星实验检测相同Cisplatin诱导及修复后耐药细胞彗星拖尾情况;随后Western Blot进一步检测DNA损伤诱导后敏感及耐药细胞p DNA-PK(S2056)的水平变化;最后Western Blot及碱性彗星实验进一步检测DNA-PK特异性抑制剂与Osimertinib分别单药及联合用药对DNA-PK活性及DNA彗星拖尾的影响。结果:1、奥希替尼耐药细胞模型(H1975-Osimertinib-Resistant,H1975-OR)构建后,CCK8检测亲本细胞(H1975-Osimertinib-Sensitive,H1975-S)的IC50值平均0.17μM,耐药细胞IC50值平均8.42μM,具有显著差异;细胞凋亡检测、结晶紫染色及Western Blot进一步证实Osimertinib获得性耐药细胞模型构建成功。二代测序未检出EGFR C797S、MET及HER2扩增、RAS突变等目前已知三代TKI耐药机制及明确新的耐药驱动基因。2、CCK8实验及联合作用定量评价软件(Calcusyn)提示,耐药细胞中化合物PI103与Osimertinib具有协同作用;随后相同实验方法检测出PI103的作用靶点中DNA-PK抑制剂与Osimertinib能协同抑制耐药细胞增殖;结晶紫染色进一步证实,DNA-PK抑制剂与Osimertinib联合作用能明显降低耐药细胞存活能力;细胞周期检测提示DNA-PK抑制剂与Osimertinib联合作用能增加耐药细胞G1期阻滞;最慢病降表达DNA-PK,耐药细胞对Osimertinib的敏感性增强。3、Western Blot显示,相同DNA损伤诱导下,耐药细胞γH2AX的水平较敏感细胞增高;碱性彗星实验表明,在相同DNA损伤诱导后,敏感及耐药细胞均出现了明显的彗星拖尾,且耐药细胞拖尾更长;撤药24小时后,敏感细胞的彗星拖尾明显缩短,而耐药细胞中依然能观察到高强度的彗星拖尾,提示耐药细胞中存在更广泛的DNA断裂和延迟的DNA损伤修复;随后,Western Blot进一步证实,相同DNA损伤诱导后,耐药细胞DNA-PK磷酸化水平较敏感细胞明显增高;最后,Western及碱性彗星实验进一步证实,DNA-PK抑制剂与Osimertinib联合作用能抑制DNA-PK磷酸化,且延长耐药细胞的彗星拖尾。结论:1、奥希替尼获得性耐药细胞模型(H1975-OR)构建成功,二代测序未发现目前已知耐药机制及明确的新的耐药驱动基因;2、靶向DNA-PK联合奥希替尼可促进细胞周期G1期阻滞,从而抑制细胞增殖;慢病毒质粒降表达DNA-PK可增强耐药细胞对Osimertinib的敏感性;3、与亲本细胞相比,奥希替尼耐药细胞的DNA修复能力下降;耐药细胞在DNA损伤应答中DNA-PK高度活化,提示耐药细胞的DNA修复可能高度依赖DNA-PK活性;靶向DNA-PK联合奥希替尼可协同抑制DNA-PK活性进而抑制DNA损伤修复,导致DNA损伤持续存在,进而促进细胞凋亡;
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研究背景和目的无限制的增殖、血管新生以及基因组不稳定是肿瘤细胞最典型的特点,肿瘤细胞经历许多代谢改变以适应加快的增殖速率和营养物质消耗,但代谢重编程使肿瘤细胞处于较高水平的活性氧环境中,为防止肿瘤细胞因活性氧过度堆积引起死亡,肿瘤细胞需要重编程还原当量稳态的代谢过程,并以此来保证细胞内有足够的谷胱甘肽等还原性物质及时清理致死的活性氧。磷酸戊糖途径是细胞内重要戊糖代谢途径,交通糖和核苷酸间的代谢,为
目的肿瘤细胞能在乏氧微环境中生存并维持不断增殖,其内的代谢结构势必发生重编程。如果能有效阻断乏氧相关代谢途径或可抑制肿瘤生长,但是对肿瘤细胞代谢重编程的具体机制仍不清楚。我们希望通过探索肿瘤细胞在乏氧和线粒体功能障碍时发生的代谢重编程,揭示其最根本的机制,并试图通过阻断相关代谢途径达到抑制肿瘤生长的目的,并为今后的肿瘤代谢研究提供有价值的参考。方法1.利用稳定同位素示踪的代谢组学分析,研究不同肿瘤
长非编码RNA(long noncoding RNA,lnc RNA)与蛋白质相互作用是lnc RNA发挥生理作用的重要途径之一。本研究中,我们通过托普霉素(tobramycin)亲和纯化的方法结合定量质谱分析的检测方法,以高效筛选细胞内的lnc RNA相互作用蛋白。我们利用该方法发现140个潜在的lnc RNA HULC(highly-upregulated in liver cancer)相互
研究背景:中国为如今全球食管癌发病率最高的国家,其中绝大多数的食管癌患者被诊断为鳞状细胞癌。放射治疗则为食管鳞癌的标准治疗方法之一,且该方法具有良好的耐受性。截止目前,我们还未曾发现有效的生物标志物来预测食管鳞癌患者的放射治疗后效果。但曾有报道指出,血小板衍生生长因子(PDGF)与多种恶性肿瘤的发生发展相关,并对患者的预后具有提示作用。因此,本研究着重评估PDGF-BB是否可以作为经放射治疗的食管
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目的:乳腺癌的发病和死亡率极高,在女性恶性肿瘤中分别位居第1位和第5位。据统计,我国乳腺癌的发病高峰年龄为48.7岁,较西方提前10年,35岁以下的年轻乳腺癌发病率明显较高,乳腺癌的发病呈年轻化趋势。虽然有研究表明,年轻乳腺癌的恶性程度相对较高,预后更差,但对于年龄小于25岁的极年轻乳腺癌(VYBC)的病理、临床和预后特征尚无确定结论。影响乳腺癌发病的因素众多,以TCGA为主的基因组学研究对乳腺癌
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研究背景:弥漫大B细胞淋巴瘤(Diffuse large B cell lymphoma,DLBCL)是最常见的血液系统恶性肿瘤,全球每年发病超过100000例。尽管近年来DLBCL的诊断和治疗有了较大的进步,但仍有高达30%的患者死于该疾病。目前DLBCL的发生机制尚不完全清楚,因此有必要寻找在肿瘤发生、发展中起关键作用的核心基因和信号通路,进一步揭示DLBCL的分子机制,为其治疗提供指导。吲哚
研究目的乳腺癌是一种起源于上皮细胞的异质性肿瘤,多年来也是世界范围内威胁女性身体健康的头号杀手。粘合连接是上皮细胞的三大主要连接方式(另外两个是紧密连接,桥粒与半桥粒)之一,已经被证实在各种癌症进展中起着至关重要的作用。而对于粘合连接在乳腺癌中的报道还很少。另外一方面,粘合连接相关蛋白1(AJAP1),又被称作Shrew-1,是最初在上皮细胞中发现的一种新的与粘合连接相关的蛋白。其已被证实在多种肿