髓系肿瘤中LeT-7A-3基因启动子低甲基化的临床研究

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目的:研究造血系统髓系肿瘤骨髓增生异常综合征(myelodysplasticsyndrome,MDS)、急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)以及慢性髓系白血病(chronic myeloid leukemia,CML)患者中let-7a-3基因启动子的甲基化态势,并探讨其临床意义。  方法:运用实时定量PCR(real-time quantitative PCR,RQ-PCR)方法检测57例AML患者骨髓单个核细胞的let-7a-3转录水平。并且运用实时定量甲基化特异性PCR(real-time quantitative methylation-specific PCR,RQ-MSP)方法分别检测95例MDS患者、128例AML患者、52例CML患者以及24例对照组健康供者的骨髓单个核细胞的let-7a-3基因启动子未甲基水平。通过亚硫酸氢盐测序PCR(bisulfite sequencing PCR)法分析AML患者let-7a-3启动子的甲基化密度。  结果:造血系统髓系肿瘤患者的骨髓单个核细胞中let-7a-3基因存在不同程度的低甲基化:  ①95例MDS患者中22例(23.2%)存在let-7a-3基因低甲基化,相比与对照组1/24例(4.2%)阳性,具有显著统计学意义(P=0.0419)。let-7a-3基因甲基化改变与患者性别、血红蛋白水平、白细胞计数、血小板计数均无相关性(P>0.05)。70岁以上患者未甲基化频率显著高于70岁以下患者(P=0.0342);低甲基化频率与患者的WHO分型和IPSS分组以及不同核型分层无相关性(P>0.05)。Kaplan-Meier生存分析显示,let-7a-3低甲基化阳性患者总体生存时间(overall survival)(中位生存时间未获得)与甲基化患者(中位生存期52月)相比无统计学意义(P>0.05)。  ②在128例AML患者中let-7a-3启动子低甲基化水平较对照组呈明显增高(中位4.51 vs0.49)(P=0.0003)。操作者特征曲线(ROC)揭示低甲基化let-7a-3可以将所有AML患者或核型正常的AML患者与正常供者区分开来,ROC曲线下面积分别为0.737或0.783(P<0.001)。其中预后好/中等核型的患者let-7a-3未甲基化水平显著高于对照组。伴有DNMT3A突变患者let-7a-3未甲基化水平有高于伴有野生型DNMT3A患者的趋势(中位数6.76 vs3.66, P=0.096)。在AML样本中,let-7a-3未甲基化水平与let-7a-3表达水平无明显相关性(R=0.197,P=0.150)。然而,给予低剂量5-aza-dC处理的K562细胞株,其let-7a-3表达增加、启动子甲基化密度下降。  ③31/52例(59.6%) CML患者let-7a-3启动子未甲基化为阳性,而对照组仅1/24例(4.2%)阳性,两组差异有显著统计学意义(P<0.001)。ROC曲线分析表明,let-7a-3启动子未甲基化作为辅助诊断CML有较好特异性。未甲基化let-7a-3启动子水平与BCR/ABL1融合基因转录水平呈显著正相关(R=0.641,P=0.001)。但与患者的白细胞、血小板计数以及血红蛋白含量无明显相关性P>0.05)。let-7a-3未甲基化水平在慢性期(中位数3.794,P=0.0421)和加速期(中位数6.635,P=0.0101)显著高于急变期(中位数:0.2696)。  结论:①let-7a-3启动子低甲基化是造血系统髓系肿瘤MDS、AML和CML患者中的常见分子事件;②在AML患者中let-7a-3启动子低甲基化与预后良好/中等核型密切相关,let-7a-3的表达部分受甲基化机制的调控;③let-7a-3低甲基化有可能能够用于CML的分子辅助诊断,并且随CML疾病进展let-7a-3低甲基化水平进行性下降。
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