蔷薇科植物病毒研究--4种病毒的分子鉴定及检测技术研究

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本文对浙江、山东、辽宁等地的蔷薇科主要经济植物上的主要病毒进行了检测和分子鉴定,比较了该科植物中的主要病毒李坏死环斑病毒(PNRSV)、苹果茎沟病毒(ASGV)、苹果花叶病毒(ApMV)和洋李矮缩病毒(PDV)分离物的序列同源性、血清型和种内进化关系,初步研究了应用玻片杂交技术来检测该科植物上以上病毒的发生概况。   通过RT-PCR方法获得8个PNRSV分离物(PNRSV-C4、PNRSV-CTA、PNRSV-C3、PNRSV-C915、PNRSV-A1、PNRSV-A2、PNRSV-P、PNRSV-R)的CP基因序列,PNRSV-P分离物CP基因核苷酸序列长度为675bp,其它7个分离物CP基因核苷酸序列长度为681bp。所获得分离物与54个其它地区的分离物进行同源性分析、血清型分析和系统进化树分析。   通过RT-PCR方法从苹果上获得2个ASGV分离物和一个ApMV分离物,分别命名为ASGV-A1、ASGV-A2和ApMV-A。对不同地区来源、不同寄主来源的12个ASGV分离物进行CP基因核苷酸和氨基酸序列进行同源性比较,核苷酸序列的同源性为90.2%~100%,氨基酸序列同源性为94.1%~100%。ASGV-A1和ASGV-A2与巴西的分离物UV01之间的核苷酸序列和氨基酸序列同源性最高,核苷酸序列同源性分别为分别为99.2%和99.6%,氨基酸同源性分别为99.6%和100%,应该是同一病毒株起源的。   通过RT-PCR方法从大连甜樱桃上获得1个PDV分离物(PDV-DL)。采用DNAStar序列分析软件将所获得的序列与21个已有文献报道的不同地区来源、不同寄主来源的PDV分离物进行CP基因核苷酸序列和氨基酸序列同源性比较,CP核苷酸序列同源性介于88.1%~98.9%之间,氨基酸序列同源性介于89.4%~99.5%之间。
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